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炎性基因与环境交互作用及胃癌易感性分析
目的 探讨胃癌患病风险的炎性基因白介素1(IL-1)、肿瘤坏死因子(TNF)及巨噬细胞转移抑制因子(MIF)与环境间交互作用.方法 用多因子降维法(MDR)模型分析基因-环境的交互作用对胃癌易感性影响,结合logistic回归分析进行补充验证.结果 佳交互作用模型是IL-1B-511、IL-1RN、TNF-A-308和肿瘤家族史的联合作用(P＜0.01),交叉验证一致性10/10,检验样本准确度为0.72;根据模型将研究对象划分为高危、低危人群,胃癌发病风险交互效应的危险度估计OR＝ 13.49,95％CI＝8.62～21.10,且交互作用有统计学意义(P＜0.01)；将危险因素按结合数量进行分析,结果显示含有1、2、3个危险因素组在病例和对照中分布差异均有统计学意义(P＜0.05),OR值分别为2.17、11.61、27.19.结论 IL-1B-511、IL-1RN、TNF-A-308和肿瘤家族史的交互作用可能增加胃癌患病风险.
关键词： 多因子降维法(MDR) 基因-环境交互作用 胃癌 -
福州郊区儿童青少年低体重影响因素的MDR分析
目的 分析儿童青少年低体重影响因素间的交互作用.方法 对福州郊区3 297名中、小学生的生长发育、营养状况及影响因素进行问卷调查.用多因子降维法(MDR)分析因素间的交互作用.据MDR模型,用多因素logistic回归模型估计交互项及其他危险因素的危险度.结果 MDR佳模型为食肉、吃青菜和吃水果的交互作用,该模型的检验样本平衡检验准确度为62.5％,交叉验证一致性为10/10.调整父亲文化、母亲文化、父亲BMI、母亲BMI等10个因素后,多吃肉类、水果类和青菜的交互作用有统计学意义.结论 在低体重儿童青少年中,肉类是主要保护因素,水果是辅助因素,与肉类起着协调作用,青菜和它们有拮抗作用.
关键词： 低体重 儿童青少年 多因子降维法(MDR) logistic回归模型 交互作用 -
基于多因子降维法的子痫前期易感基因-基因交互作用研究
目的:了解子痫前期(PE)易感基因多态性(SNP)在中国人群中的分布特点,探讨SNP与PE遗传易感性之间的关系;应用多因子降维法(MDR)分析SNPs的交互作用,以期建立PE的多基因预测模型用于疾病风险的评估.方法:收集深圳地区中国汉族PE患者156例与正常妊娠妇女286例,SnapShot技术进行基因型鉴定,用卡方检验进行单位点关联分析,MDR法分析基因-基因交互作用;并构建多位点logistic模型.结果:(1)经Buffarrony校正后,eNOS基因rs2070744等位基因频率分布在中国汉族人群中有统计学差异,PE组"C"等位基因频率明显高于对照组(C vs T:χ2=8.852,P=0.003).(2)中国汉族人群中暂未发现rs1800580、rs5742620、rs6020、rs1799963、rs1799889、rs4986791、rs4986790、rs268位点存在多态性.(3)佳交互作用模型包含EPAP2(rs2549782)、GSTP1(rs1695)、AGT(rs4762)、IL-10(rs1800896)、APOE(rs7412)和TNF-alpha(rs1800629、rs1799724).训练样本准确率为0.7294,验证样本准确率为0.5853,交叉验证一致性为10/10(P=0.001).(4)基于MDR结果构建的logistic回归模型结果显示,rs1800896、rs1799724、rs2070744、rs4762及rs7412位点有统计学意义.结论:中国汉族人群PE风险遗传因素具有人种特异性;MDR方法是对PE的多因素效应估计的新尝试,6个PE易感基因存在交互作用,可能对中国人群PE的发病起重要作用.
关键词： 多因子降维法(MDR) 基因-基因交互作用 子痫前期 -
基于多因子降维法模型的代谢酶易感基因多态性与乳腺癌患病风险的交互作用研究
目的 运用多因子降维法(MDR)分析代谢酶易感基因多态性对乳腺癌患病风险的交互作用,并评价MDR模型的具体应用.方法 采用配对病例对照研究,共收集按年龄和绝经状态匹配的病例对照对子78对.用PCR-RFLP和多重PCR法分别检测调查对象CYP1A1 MspⅠ、GSTM1以及GSTT1易感基因类型;运用MDR法分析基因-基因交互作用模型;并构建优的乳腺癌的环境及基因的logistic模型.结果 有统计学意义的佳交互作用模型是CYP1A1 MspⅠ突变基因型与GSTT1 null基因型的联合作用(sign检验,P=0.05), 该模型的检验样本平衡准确度为0.5920,交叉效度一致性的结果为10/10.根据MDR分析结果构建的条件logistic回归模型结果显示,被动吸烟、未足月产数以及GSTT1 null基因型和CYP1A1 MspⅠ突变基因型的交互项是乳腺癌的危险因素,Ors分别为12.234(1.7459～85.7279)、 4.554(1.3250～15.6507)和9.597(1.5783～58.3599).结论 将MDR法与参数估计的分析方法相结合,是对肿瘤等慢性非传染性疾病的基因-基因或基因-环境多重病因效应估计的有益尝试.CYP1A1 MSPⅠ突变基因型及GSTT1缺失基因型可能协同干扰雌激素代谢的过程,从而增加了乳腺癌的发生风险.
关键词： 多因子降维法(MDR) 基因-基因交互作用 乳腺癌
