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因随机方差模型文献资料
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差异表达基因鉴别的SAM和RVM的比较
目的探讨小样本量情况下基于两种不同理论对方差进行调整的SAM和RVM方法在差异表达基因鉴别中的性能.方法以真实实验数据作为参数估计的基础进行理论数据的模拟,并基于理论数据对SAM、基于permuta-tion的SAM和RVM的性能进行了探讨.结果基因的对数表达比的残差方差较好地符合反伽马分布,在设定的不同差异表达基因比例情况下,基于permutation的SAM法的鉴别性能高,RVM次之,SAM低.结论基因残差方差的分布可以用反伽马分布拟合,基于permutation的SAM和RVM具有较好的检测差异表达基因的性能,SAM在估计校正系数时应考虑差异表达基因的比例.
