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乙型肝炎病毒聚合酶蛋白多态性的生物信息学分析及其意义
目的通过Bio-HBV生物数据库,针对乙型肝炎病毒(HBV)聚合酶蛋白序列进行多态性分析.方法构建Bio-HBV生物数据库,获得国际基因序列库中所有完整的聚合酶蛋白并进行比对,采用信息熵评价序列位点的保守性,结合BLOSUM90评分系统和PAML方法,寻找选择压力下的理化性质异常的氨基酸替换模式.结果 rt266-271内频发理化性质异常的氨基酸替换,并且具有高度的统计学意义.此外,还用生物信息学的方法分析了聚合酶蛋白的TP、RT和RH功能域的保守性.结论用生物信息学验证了功能域内已知生物学特性位点的保守性,还从结构生物学出发,推测潜在的功能位点及其意义.