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CDCA8和INCENP mRNA在肝细胞癌组织中的表达及其临床意义
目的:探讨CDCA8和INCENP mRNA在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达及其临床意义.方法:使用Illumina Nextbio芯片数据库分析原发性HCC组织和相应癌旁组织中CDCA8和INCENP mRNA表达情况,在癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肝癌数据库中使用RNA-Seq mRNA表达数据进行验证,并结合TCGA临床数据分析CDCA8和INCENP mRNA表达水平与HCC患者临床病理特征及预后的关系,使用基因集富集软件分析目的基因高表达的相关通路.结果:CDCA8和INCENP mRNA在HCC组织中表达水平显著上调(P＜0.01).CDCA8 mRNA表达水平与HCC的组织学分级、瘤体大小、肿瘤复发、美国东部肿瘤协作组织(ECOG)评级、血清AFP水平、肿瘤基因拷贝数变异显著相关(P＜ 0.05);INCENP mRNA表达水平与HCC的组织学分级、肿瘤复发、ECOG评级、血清AFP水平、肿瘤基因突变总数和肿瘤基因拷贝数变异显著相关(P＜0.05).CDCA8高表达组患者的OS及TFS显著低于CDCA8低表达组患者(P＜0.01);INCENP高表达组患者的OS显著低于INCENP低表达组患者(P＜0.05),而TFS无显著差异(P＞0.05).多因素分析显示,CDCA8 mRNA水平是预测HCC患者不良预后的独立因素(P＜0.01).基因集富集分析表明,CDCA8和INCENP可能在细胞周期之外的其他生物学信号通路中发挥一定作用.结论:CDCA8和INCENP mRNA在HCC组织中呈现显著高表达.CDCA8可能成为HCC预后的独立风险因素和新的治疗靶点.
关键词： 肝细胞癌 肿瘤基因组图谱 细胞分裂周期相关蛋白8 内着丝粒结合蛋白 预后 -
肿瘤基因组图谱泛癌分析计划
由于起源部位、细胞类型、基因突变形式的不同,肿瘤可表现出不同的形态.这些因素同时影响肿瘤的治疗效果.虽然已经证实许多基因的改变直接导致了表型的改变,然而,许多肿瘤谱系中复杂分子机制依然未完全阐明.因此,肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)研究网络分析了大量人类肿瘤,以期发现DNA、RNA、蛋白质和表观遗传学水平的分子改变.含丰富数据的结果给我们提供了一个机会,对整个肿瘤谱系的共性、个性及新观点形成一个整体描绘.基因组图谱泛癌计划先比较了12种肿瘤类型.对不同肿瘤分子改变及其功能的分析,未来会告诉我们如何将有效的治疗方法应用于类似基因表型的肿瘤.
