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蛋白与蛋白相互作用网络文献资料
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生物信息学分析患有乳腺癌的乳腺球样本中与自我更新相关的关键基因
目的:通过生物信息学分析乳腺癌中具有自更新能力的乳腺球样本,挖掘与自更新能力有关的关键基因,为乳腺癌治疗提供基础和理论依据.方法:首先通过比较原位乳腺癌样本(breast cancer,BC)与乳腺癌的乳腺球样本(mammosphere samples,MS)的mRNA芯片表达数据,获得差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs).随后构建DEGs的蛋白与蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并从中筛选出一个高度关联的子网络,后对子网络进行功能富集分析.结果:MS和BC两组样本间共有1083个DEGs.从这些DEGs构建得到的PPI网络中,获得了一个包含49个DEGs的高度关联的子网络,其中tspo、igf1、fn1和cdk1为子网络的核心基因.结论:这些核心基因可能是乳腺癌细胞中与自更新相关的基因.
关键词： 乳腺癌 乳腺球 自我更新 差异表达基因 蛋白与蛋白相互作用网络
