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  • 一种快速、高通量的基因分型新方法

    作者:吴刚;李梅

    目的建立一种基于单碱基延伸原理的基因分型新方法 ,即 SnaPshot.方法设计单条PCR引物,使其将要延伸的第一个碱基就是需进行基因分型的位点,用荧光标记的双脱氧NTP(ddNTP)作为测序底物,使测序反应只延伸一个碱基,从而能够鉴定该SNP.结果 SnaPshot能同时对7~8个不同的SNP位点进行96个样本基因分型.结论 SnaPshot是一种快速、高通量的基因分型新方法,可加快基因分型以及疾病致病基因的研究速度.

  • 用芯片电泳快速检测人p53基因外显子8上的突变点

    作者:宋沁馨;李正平;周国华;倪坤仪

    目的:建立简单快速的分析方法检测基因突变.方法:利用修饰引物进行特异性单碱基延伸,采用Cy5荧光染色标记的ddNTP,并通过芯片电泳来检测.结果:实测了合成人p53基因外显子8上突变点的3种可能形态(野生型,突变型和杂合型),并测定了一系列不同比例突变率的混合样本,低至5%突变率.所有样本分别于芯片电泳中在100 s之内被检测出来.结论:该方法操作简单易行,可用于快速检测已知的基因突变.

  • 人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点单核苷酸多态性检测方法的建立

    作者:焦杰;谢玉为;邬兰;杜同信;王自正;俞杨

    目的 建立使用单碱基延伸技术检测人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点单核苷酸多态性的方法.方法 制备人全血基因组DNA样本,使用自行设计的引物扩增包含人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点的片段并纯化,通过单碱基延伸反应制备CISH+1320的样本,采用毛细管电泳检测CISH+1320的单核苷酸多态性,并使用DNA测序方法验证单碱基延伸方法的准确性.结果 7例样本的单碱基延伸法检测结果与DNA测序结果完全符合.结论 单碱基延伸法可以用于人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点单核苷酸多态性的检测,结果准确可靠.

  • 法医SNP复合检测体系的构建及应用

    作者:李彩霞;于子辉;贾竟;魏以梁;胡兰;万立华

    目的 构建48-SNP位点复合检测体系,用于个体识别、性别鉴定、ABO基因分型.方法 采集225份无关个体样本(血斑及口腔拭子),18份案例样本(不同组织及体液斑),选择43个常染色体位点、4个ABO基因位点和1个性别鉴定位点,根据单碱基延伸技术通过GenomeLabTM SNPstream(R)基因分型系统进行SNP分型;并检测体系灵敏度、同一个体不同组织同一性及模拟腐败检材.结果 48 -SNP体系分型结果与测序结果的一致性为100%,小DNA检出量为0.25ng,不同组织来源样本检测同一性很好;利用该体系检测225名无关汉族个体,所有位点均符合Hardy-Weinberg平衡,整个系统的随机匹配概率为9.4×10-18,累积非父排除率(CEP)为0.999 788,累积个体识别率大于0.99999999999999999.结论 本文48-SNP体系能同时进行个体识别、ABO基因分型和性别鉴定,可以作为现有STR检验体系的补充.

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