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达卡气单胞菌文献资料
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用gyrB、rpoD基因扩增测序进行气单胞菌分类的探讨
目的 获得气单胞菌更准确的分类结果.方法 收集经Vitek全自动细菌分析仪及配套的GN鉴定卡鉴定为气单胞菌的菌株231株,对其gyrB、rpoD两个管家基因进行PCR扩增及测序,并与GenBank中标准序列进行基因序列比对和单核苷酸替代率分析,综合分析gyrB、rpoD两基因测序结果并进行基因分类.结果 231株气单胞菌中,69株(29.9%)gyrB和rpoD基因均获得测序结果,86株(37.2%)仅获得gyrB序列,50株(21.6%)仅获得rpoD序列,26株(11.3%)两种基因均未获得序列.生化表型鉴定为嗜水气单胞菌的菌株中62.7%基因分类结果为达卡气单胞菌,仅22.4%为嗜水气单胞菌,其种间生化反应结果相近.结论 气单胞菌属的生化分类与基因分类结果存在差异.达卡气单胞菌与嗜水气单胞菌的鉴定依赖于基因序列分析.