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  • 基于药效团模型及虚拟筛选方法发现 EphB4全新抑制剂

    作者:邵鑫;衣倩颖;杨春蕾

    采用计算机模拟手段,通过建立3D-QSAR 模型、虚拟筛选及分子对接方法发现恶性肿瘤治疗靶标 EphB4潜在的抑制剂。首先,通过 Catalyst/HypoGen 算法建立药效团模型。其中好的模型 Hypo1具有高的科雷尔值(Correl 值):0.96,低的 RMS 值:0.89,与固定消耗值(fixed cost):89.20,接近的总消耗值(total cost):101.26,和高的Δ消耗值(Δcost 值):89.14。随后,Hypo1经过测试集验证及 Fischer 随机验证,并用于筛选化合物数据库。然后利用类药性筛选及分子对接手段进一步减少分子数量。终,根据预测活性分析、对接得分值及结合模式分析,得到23个具有全新骨架的化合物作为 EphB4的潜在抑制剂可用于后续研究。

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