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H1a亚型文献资料
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杭州地区2015年麻疹病毒核蛋白的基因特征
目的 了解2015年杭州地区麻疹病毒(MV)流行株的核蛋白基因特征.方法 收集2015年在杭州市儿童医院(麻疹定点收治医院)住院麻疹患儿中分离得到MV株共18株,用RT-PCR检测并对部分PCR扩增阳性的片段进行基因测序,绘制系统进化树进行同源性分析.结果 18株MV经基因测序及系统进化树分析后均为H1a亚型,与该型参考株China93-2﹑China93-4核苷酸同源性为98.65％～98.88％;与GenBank登记的Jiangxi.CHN/23.11的MV株核苷酸同源性高达99.55％～99.78％,具有高度同源性,属于同一分支.遗传距离分析表明:2015年分离株组内遗传距离小,为0.000,2015年分离株和H1a型之间的组间遗传距离小,为0.013,而2015年分离株、H1a型与A型的组间遗传距离均较大,分别为0.081及0.083.结论 2015年杭州及周边地区儿童MV野毒株的优势亚型为H1a亚型,且为同一传播链,未发现疫苗株及其他型别.
