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长链非编码RNA XLOC_005009在食管鳞状细胞癌中的表达及其甲基化状态
[目的]通过检测长链非编码RNA XLOC 005009在人食管癌细胞系及食管鳞状细胞癌(ESCC)组织中的表达情况及其甲基化状态,探讨XLOC_005009基因在食管鳞癌发生、发展中的作用及表观遗传学失活机制.[方法]分别应用逆转录一聚合酶链反应以及甲基化特异性聚合酶链反应的方法检测XLOC_005009基因在DNA甲基化转移酶抑制剂5-Aza-dC处理前后的食管癌细胞系(TE1、TE13、T.Tn、Eca109)以及57例食管鳞癌组织及相应癌旁正常组织中的表达情况和各位点的甲基化状态.[结果] XLOC_005009基因的表达在5-Aza-dC处理后的4株细胞系中表达增高,在5-Aza-dC处理前的4株细胞系中XLOC_005009基因的3个位点均表现为高甲基化状态,在5-Aza-dC处理后,各位点甲基化程度均降低.XLOC 005009基因在ESCC中的表达明显低于对应癌旁正常组织(0.21±0.22 vs 0.32±0.29,P＜0.05),其远端CpG岛及第2外显子区甲基化率在ESCC与其癌旁正常组织中差异无统计学意义,且其在发生甲基化的ESCC与未发生甲基化的ESCC中的表达无统计学差异.第一外显子区甲基化率在ESCC中显著高于其癌旁正常组织[45.61％(26/57)vs 19.30％(11/57),P＜0.05],并与淋巴结转移、组织分化程度及TNM分期密切相关,且此位点发生甲基化的ESCC中该基因的表达显著低于未发生甲基化的ESCC组织(0.06±0.06 vs 0.33±0.23,P＜0.05).[结论]XLOC_005009基因在食管癌细胞系和ESCC中的低表达与ESCC的发生、发展密切相关,且其第一外显子区甲基化异常增高可能是导致其表达沉默的机制之一.
关键词： 食管癌 鳞癌 XLOC_005009 长链非编码RNA DNA甲基化
