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蛋白质组学技术筛选新的卵巢癌多药耐药靶向蛋白的研究进展
卵巢癌是妇科常见的恶性肿瘤,化疗耐药是影响卵巢癌患者预后的主要原因.近年基因组工程从DNA和RNA水平阐明了多药耐药的遗传基础,但是,未能精确描述肿瘤耐药细胞在蛋白质水平所发生的一切.肿瘤蛋白质组学的出现及其研究技术的发展和完善使在蛋白质整体水平上研究多药耐药产生的机制成为可能.现结合国外近5年的研究,对利用蛋白质组学技术筛选新的卵巢癌多药耐药靶向蛋白作一综述.
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肿瘤蛋白质组学与消化系肿瘤生物标记
肿瘤蛋白质组学是通过蛋白质组技术研究肿瘤细胞中蛋白质及其相互作用的新的学科.将蛋白质组学技术用于研究肿瘤的发病机制、寻找新的肿瘤诊断生物标记以及采用组织蛋白质组图谱-进行早期诊断等早已引起了人们的广泛关注.肿瘤蛋白质组学可能会引起肿瘤临床实践的重大革命.本文对近年发现的肿瘤生物标记进行了回顾,分析了肿瘤蛋白质组学存肿瘤生物标记发展中的前景.
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肿瘤蛋白质组学:过去、现在和将来
将蛋白质组学的技术方法应用到肿瘤生物学的研究中,产生了-门新学科--肿瘤蛋白质组学.它以寻找肿瘤标志物为目的,以蛋白质组学方法为手段,结合肿瘤分子机制的基础研究与肿瘤检测、诊断等临床研究.终产出能应用于临床的肿瘤检测和治疗的蛋白质靶标.肿瘤蛋白质组学经历了表达谱、修饰谱到活性谱的进化过程,在不同的层面上揭示肿瘤可能的致病机制.本文概述了近年来在常见的恶性肿瘤中进行的肿瘤蛋白质组研究,应用各种蛋白质组技术方法,如二维凝胶电泳(two-dimensional gel eleetrophresis,2DE)、细胞培养稳定同位素标记技术(stable isotope labeling by amino acid in cell culture,SILAC)、基质辅助激光解析(matrix assisted laser desorption/ionization,MALDI)质谱等,找到了大量的蛋白质标志物.将来的挑战在于如何从理论上应用候选标志物解析肿瘤的分子机制,以及从实践上鉴定能真正应用于临床的标志物.
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晚期NSCLC患者EGFR-TKI治疗过程中血清多肽变化及其临床意义的探索性研究
背景与目的本研究旨在应用基质辅助激光解析离子化-时间飞行质谱仪（matrix-assisted laser desorption ionization time-of-lfight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS）检测晚期非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer, NSCLC）患者在接受表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂（epidermal growth factorreceptor tyrosine kinase inhibitors, EGFR-TKIs）治疗过程中血清多肽的变化并探索其临床意义。方法收集34例接受EGFR-TKI治疗的晚期NSCLC患者TKI治疗前、佳疗效时及疾病进展后的自身配对血清样本102份。处理血清样本并应用MALDI-TOF-MS检测，得到质谱图后使用CPT统计软件进行分析，鉴定出差异多肽，并对其临床意义进行分析。结果34例接受EGFR-TKI治疗的患者无完全缓解（complete response, CR）患者，部分缓解（partial response, PR）11例，疾病稳定（stable disease, SD）23例，中位无进展生存期（progression-free survival, PFS）为8.0个月（95%CI：6.6-11.2）；中位总生存期（overall survival, OS）为11.4个月（95%CI：10.6-16.5）。对TKI治疗的三个不同时间点的血清进行质谱检测，结果显示三个时间点多肽指纹图谱均不相同；配对分析佳疗效时与基线时质谱数据经CPT软件共鉴定出差异多肽峰87个，筛选出两组间有统计学差异[P<0.001、曲线下面积（area under curve, AUC）≥0.9]的多肽峰1个；疾病进展时与基线时共鉴定出差异多肽峰96个，筛选出两组间有统计学差异（P<0.001, AUC≥0.9）的多肽峰3个；佳疗效时与疾病进展时共鉴定出差异多肽峰115个，筛选出两组间有统计学差异（P<0.001, AUC≥0.9）的多肽峰4个。结论 NSCLC患者TKI治疗过程中血清多肽存在动态变化，差异多肽可能与治疗效果、疾病进展相关，差异多肽的特性、临床意义需进一步鉴定和验证。
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MALDI-TOF质谱筛查NSCLC患者血清特异性多肽的探索性研究
背景与目的 早期诊断是提高肺癌生存率的关键,传统的肺癌诊断技术仍存在一定局限性.鉴于近年来以质谱为核心技术的肿瘤蛋白组学在癌症诊断方面的初步研究,本研究探索性应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization-time of flight-mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)分析非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者和健康人群的血清差异多肽,以建立NSCLC的血清分类模型.方法 将年龄和性别匹配的133例NSCLC患者和132例健康者血清标本按照3∶1的比例随机分为两组:训练组由100例NSCLC患者和100例健康者血清标本组成,用以建立分类模型；测试组由33例NSCLC患者和32例健康者血清标本组成,用以验证模型.采用铜离子鳌合纳米磁珠提取血清多肽、MALDI-TOF-MS技术检测得到质谱图.ClinProToolsTM统计软件分析训练组NSCLC患者与健康者之间的多肽图谱,从中筛选出一组差异多肽并建立分类模型,后用测试组对模型进行盲样验证.结果 在训练组中观察到血清质荷比(m/z)在1,000 Da-10,000 Da范围内有131个差异多肽信号峰,在此范围内共得到14个有统计学意义的差异多肽峰(P＜0.000,001; AUC≥0.9),其中NSCLC患者与健康者相比,表达上调的多肽有2个,表达下调的有12个,由统计软件筛选出3个多肽峰(7,478.59 Da、2,271.44 Da、4,468.38 Da)建立分类模型,然后对测试组进行验证,其盲样验证敏感性100％,特异性96.9％,准确率98.5％.结论 本组研究显示NSCLC患者与健康人群的血清多肽存在差异,应用MALDI-TOF-MS技术可建立NSCLC的血清多肽分类模型且小规模验证具有较好的敏感性和特异性,希望大规模验证模型,并与传统诊断方法对照或结合,进而尝试建立一种新的NSCLC早期诊断模式.
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蛋白质组学与转化医学:用以癌症诊断、预后和疗效预测的分子生物标记物
"生物医学研究的新技术进展使鉴定多种分子生物标记物变得更加容易,有助于促进癌症筛查和检测……通过允许医生为患者制定个体化治疗来提高癌症治疗的有效性和安全性."癌症是当今世界的主要致死原因.癌症生物标记物对于良好的治疗效果和远期疗效至关重要,并可降低病痛和疾病相关的社会支出.全世界恶性肿瘤的高负担突显了用以癌症诊断、预后和疗效预测的生物标记物的未尽潜能.迫切需要新型策略以发现癌症生物标记物并将分子诊断从实验研究转化至临床实践[1,2].
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甲状腺肿瘤蛋白质组学研究进展
蛋白质组学是在后基因组时代出现的一个新的研究领域,肿瘤蛋白质组学是其重要分支.本文从甲状腺肿瘤特异性分子标志物以及甲状腺癌治疗的分子靶点等几个方面,详细介绍了近几年来甲状腺肿瘤蛋白质组学的研究现状.
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肿瘤蛋白质组学的应用现状和发展前景
肿瘤蛋白质组学可用于了解肿瘤的早期诊断,病程监测,以及药物筛选等方面.本文主要以肿瘤蛋白质组的研究技术和对肿瘤的筛选而解释它的研究进展.
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血清蛋白质组图谱的检测与识别是否有望成为临床癌症早期诊断的新方法?
使用蛋白质质谱技术发现可以早期确诊组织癌变的新肿瘤标记物是近年来癌症蛋白质组学研究的一个重要方向.高通量的蛋白质质谱技术的发展不仅为人们在蛋白质水平上全面了解组织癌变的分子机理提供了物质基础,也加速了组织特异的血清肿瘤标记物的发现.近出现的基于蛋白芯片(ProteinChip)的SELDI-TOF质谱巧妙地将色谱分离和蛋白质谱两技术结合为一体,使其可以快速地分析各种生物样品中蛋白质组的组成.基于器官组织的生理状态变化会引起血清蛋白质组的改变的理论,人们试图使用SELDI-TOF质谱来检测组织特异的血清蛋白质组图谱,进而实现癌症的早期诊断.该技术已在前列腺癌、卵巢癌和乳腺癌的诊断研究中取得令人侧目的进展.作为一项引人关注的新型技术,它同时也引发了热烈的学术辩论.本文围绕SELDI-TOF技术原理、其在肿瘤标记物发现研究中的应用, 使用血清蛋白质组图谱诊断癌症的研究进展和与其有关的学术辩论作简要综述.
关键词： 肿瘤蛋白质组学 肿瘤标记物 SELDI-TOF质谱 蛋白质组图谱 诊断
