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实时荧光PCR技术在沙门菌种间鉴别中的应用
目的 探讨用实时荧光PCR对沙门菌进行种间鉴别.方法 根据猪霍乱沙门菌(Salmonella Choleraesuis,SC)和丙型副伤寒沙门菌(Salmonella paratyphi C,SP)的共有序列(GenBank:AE017220.1),伤寒沙门菌(Salmonella Typhi,ST;GenBank:NC_016832.1)和鸡伤寒沙门菌(Salmonella Gallinarum,SG;GenBank:HQ703462)的特异序列分别设计SCP、STP、SGP引物和TaqMan探针,在探针的5'端分别标记FAM、HEX、TET,建立基于TaqMan探针多重荧光PCR检测方法.同时,根据SC和SP差异序列(GenBank:CP000857)设计SPP引物和探针,在探针的5'端标记ROX,区分SC和SP.结果 SCP特异性扩增出25株SC和22株SP,STP和SGP分别扩增出31株ST和34株SG,而其他不同血清型沙门菌和非沙门菌扩增结果阴性.SPP扩增出22株SP,25株SC扩增结果阴性.扩增体系评价结果,SCP、STP、SGP和SPP扩增效率均在80% ~ 100%,线性相关系数r2≥0.994.结论 建立的方法特异性强、敏感性高,可用于SC、SP、ST、SG的种间鉴别.