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食管癌相关基因片段的筛选与鉴定
目的:从已构建的中国人食管癌特异的消减cDNA文库中,初步筛选与鉴定食管癌相关基因片段.方法:随机挑选48个片段作反Northern印迹杂交分析,将杂交信号有差别的15个片段送测序公司进行测序,用Gen Bank Blast程序检索,以同源性很小的cDNA片段作为新基因的候选基因,观察其在食管癌组织和正常食管粘膜组织中的表达情况.结果:所获得的7个序列中:3y59与已知基因同源性很小,且3y59在30例食管癌及其配对正常食管粘膜组织中,19例(63.3%)表达有差别,11例(36.7%)表达无差别(P<0.05).3y88与已知基因geminin基因部分同源.另外5个片段3y20,3y14,3y90,3y91和3y92分别与核糖体蛋白RpL7a,TLH29蛋白驱动子,Hsp70/Hsp90 organizing protein,Keratin6(KRT6C)和内膜蛋白等已知基因序列高度同源.结论:3y59可能是与食管癌的发生、发展有关的新的候选基因.首次发现,geminin基因,核糖体蛋白RpL7a,TLH29蛋白驱动子,Hsp70/Hsp90-organizing protein,Keratin6(KRT6C),内膜蛋白等已知基因可能与食管癌的发生发展有关.
关键词: 食管癌 基因 消减抑制杂交 反Northern印迹杂交 反转录PCR