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灰斑古毒蛾核型多角体病毒三个晚期表达因子基因
将灰斑古毒蛾(Orgyia ericae)单粒包埋型核型多角体病毒(OrerSNPV)基因组DNA的各EcoRI酶切片段进行克隆和测序.序列分析结果表明EcoRI-M(3.0kb)与EcoRI-P片段(2.2kb)相连处含有编码晚期表达因子(LEF-2)的开放阅读框(ORF).同时在EcoRI-E(约10kb)片段两端分别含有lef-3和lef-11基因的部分序列.lef-2基因编码区由648bp组成,可编码216个氨基酸残基的多肽,预计蛋白质分子量为23.7kDa.将OrerSNPVLEF-2氨基酸序列与其它已知的27种杆状病毒的LEF-2序列比较,发现OrerSNPV与其它鳞翅目NPV LEF-2氨基酸有35%~49%同源性,其中与BusuSNPV、MaMNPV-A、HezeSNPV、HearSNPV和LdMNPV同源性高,和GV有26%~31%同源性,与膜翅目松柏锯角叶蜂NPV的同源性为32%,与库蚊杆状病毒的同源性只有23%.根据氨基酸序列绘制的分子进化树表明28种杆状病毒lef-2基因可以分为鳞翅目NPV、GV、膜翅目NeseNPV与双翅目Culex nigripalpus Baculovirus四个分支.OrerSNPVlef-2与BusuSNPV在进化树上关系为接近,而OrerSNPVlf-3和LdMNPV的接近,OrerSNPVlef-11则和SeMNPV的关系接近.
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中国棉铃虫核多角体病毒基因组 Xba I-I片段的序列分析
报道了棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(HaSNPV)XbaI-I片段的序列结构.该片段在基因组上定位于18.4~22.8 m.u., 包括8个完整的开放阅读框架和p47的5′端部分序列:其中ubiquitin, 39K/pp31, lef-11, p47, Ac34, Ac38和Lsel25 homologue 7个基因是杆状病毒的同源基因, 另外两个orf507和orf1 080是HaSNPV的特有基因,且具有典型的早期表达基因启动子的特征,经软件分析发现这两个基因推导的产物具有典型的跨膜压结构.序列比较分析表明, ubiquitin基因与其它杆状病毒的同源基因有相同的保守区, 39K/pp31具有和其它杆状病毒同源基因不同的启动子结构.