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密码对文献资料
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几种模式生物密码对的偏好模式分析
目的:从进化的角度研究古菌、细菌和真核生物基因组中密码对的使用,得到密码对使用与生物进化的可能的规律.方法:生物统计学.结果:首先,比较了编码序列中密码对出现频数的观测值与理论值之差的分布,发现这种分布基本是随机的;其次,这个分布也表明密码对的使用普遍具有偏好性,且不同物种所偏好的密码对和偏好的程度是不同的；第三,终止密码对的使用也存在偏好性,对于同一个密码子与不同的终止密码组合时,其观察值与理论值的关系依赖于终止密码子的类型.结论:结果表明密码对的使用与基因组进化存在相关性.
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闪烁古生球菌基因中密码对的偏好性
目的:如同密码子的偏爱性使用一样,密码对的使用也有偏爱性,为了揭示基因组中密码对使用的规律,对闪烁古生球菌基因组中密码子及其紧邻密码子(密码子对)偏爱分布作较全面的统计分析.方法:生物统计学.结果:通过定义密码对的相对丰度,发现81%的密码子对其紧邻密码子有偏爱性,这种偏爱性与同义密码子的使用有关.此外,通过密码子及其紧邻密码子与全序列六联体的相对丰度比较发现,大约30%的紧邻密码对偏爱性不能用基因组的序列组分来解释.结论:密码对的偏爱性与它的核苷酸组分有显著相关性.
