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作用于HIV-1 gp120小分子HIV进入抑制剂NC-2的虚拟筛选及其作用机制
目的 基于中和抗体VRC01与HIV-1 gpl20的结合模式,利用计算机虚拟筛选,从IBS天然产物数据库中筛选靶向HIV-1gpl20的小分子HIV-l进入抑制剂,并对其抗病毒活性和机制进行研究.方法 运用MM-PBSA方法计算候选化合物与HIV-1gpl20结合后自由能的变化；利用HIV-1假病毒、活病毒技术及细胞融合实验,检测化合物抑制HIV-1感染的活性；XTT比色法检测化合物对细胞的毒性；采用酶联免疫吸附测定法(ELISA)研究化合物体外抗病毒活性的机理.结果 利用计算机从40 000个化合物中虚拟筛选出19个与gpl20结合后自由能降低较大的小分子化合物,其中NC-2具有抑制HIV-1感染和细胞融合的活性,其抑制HIV-1实验株ⅢB的IC50是1.95±0.44 μmol/L,抑制HIV-1JRFL假病毒的IC50是10.58±0.13 μrmol/L.酶联免疫吸附法结果表明NC-2体外能抑制HIV-1 gpl20与CD4的结合,但不抑制HIV-1 gp41六螺旋的形成.结论该计算机虚拟筛选的方法可为开发作用于HIV-1 gpl20的小分子进入抑制剂提供参考.同时,通过计算机辅助设计加病毒活性筛选的方法,得到一个新颖结构的HIV进入抑制剂NC-2.
关键词： HIV-1进入抑制剂 gpl20 VRC01 计算机辅助设计 药物筛选 -
日本蛇菰中咖啡酰基葡萄糖类化合物抑制HIV-1进入的机制
目的 研究从日本蛇菰中分离的咖啡酰基葡萄糖类化合物抑制HTV-1进入的作用机制.方法 利用HTV-1假病毒体系,并结合针对gp41包膜蛋白的ELISA以及分子对接方法,对日本蛇菰分离的咖啡酰基葡萄糖类化合物抑制HIV-1进入机制进行研究.结果 我们首先用HIV-1 Env假病毒来检测六个咖啡酰基葡萄糖类化合物(终浓度:25μg·ml-1)的抑制活性.发现1,2,6-三-O-咖啡酰基-β-D-吡喃葡萄糖(TCGP)和1,3-双-O-咖啡酰基-4-O-没食子酰-β-D-吡喃葡萄糖(DCGGP)具有较好的抑制病毒进入靶细胞的作用.进一步量效关系研究表明,两个化合物的病毒抑制活性呈剂量依赖性,它们的IC50值分别是(5.5±0.2)和(5.3±0.1)μg·ml-1.这两个化合物的抑制活性与其抑制gp41六螺旋束结构形成的机制有关.分子对接表明,它们均能靶向gp41上N-螺旋三聚体的靶穴位置.结论 1,2,6-三-O-咖啡酰基-β-D-吡喃葡萄糖(TCGP)和1,3-双-O-咖啡酰基-4-O-没食子酰-β-D-吡喃葡萄糖(DCGGP)可以较好的抑制HIV-1 Env假病毒感染靶细胞,可作为先导化合物来研发抗HIV-1新药.
