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has-mir-1246文献资料
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cnhsa-mir-1246在食管癌细胞株中的表达及其生物信息学分析
目的 检测食管癌细胞株KYSE-150和正常食管上皮细胞株Het-1A中hsa-mir-1246的表达,并对hsa-mir-1246进行靶基因预测及相关生物信息学分析,为深入研究hsa-mir-1246在食管癌发生、发展过程中的分子机制提供理论依据和实验基础.方法 应用qRT-PCR技术检测食管癌细胞株KYSE-150中hsa-mir-1246的表达水平,并与正常对照细胞株对比;通过miRBase、NCBI、UCSC Browser等在线工具分析hsa-mir-1246序列;应用TargetScan、miRanda及miRBD预测hsa-mir-1246的靶基因,进行功能富集分析和信号通路富集分析.结果 (1)食管癌细胞株中hsa-mir-1246表达水平明显高于正常对照细胞株(86.67±16.87 vs 30.95±11.51,P＜0.05).(2)miRNA-1246在人类同源的物种之间具有高度保守性.(3)3种预测网站得到hsa-mir-1246靶基因分别为114个、5 983个、398个,交集为13个.(4)hsa-mir-1246靶基因功能分别富集于转录的调控、信号转导、染色质修饰、细胞周期等生物学过程(P＜0.001),涉及基底细胞癌、神经胶质瘤、Wnt信号通路、长时程增强效应等信号转导通路(P＜0.05).结论 hsa-mir-1246靶基因参与肿瘤发生的多种生物学过程,提示hsa-mir-1246可能与食管癌的发病机制密切相关.
关键词： 食管癌 has-mir-1246 生物信息学 靶基因
