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分枝杆菌散在重复单位对结核分枝杆菌分型的研究
目的 评价分枝杆菌散在重复单位(MIRU)分型方法在结核病流行病学上的应用,探讨该方法的应用前景.方法 采用MIRU分型对158株结核分枝杆菌进行基因分型,这些菌株均已进行IS6110-RFLP分型.结果 MIRU分型结果产生只需1 d.158株结核分枝杆菌共产生105个类型,其中65个为独特类型.在MlRU的12个区中,重复区4、10、26、40具有较高的多态性.用Hunter-Gaston Index(HGI)对2种方法进行评价,IS6110-RFLP的分辨指数为99.4 %,MIRU技术的分辨指数为97.8%.当IS6110拷贝数小于等于10个时,IS6110-RFLP的分辨指数为98%,MIRU的分辨指数达到98.2%.结论 MIRU分型方法具有快速、简便、分辨力较高的特点,便于普及,可在结核病分子流行病学研究中发挥重要作用.
关键词： 分枝杆菌 结核 分枝杆菌散在重复单位 IS6110 RFLP -
河南省部分地区结核分枝杆菌散在分布重复单位及多位点串联重复序列(MIRU-VNTR)基因分型技术的研究
[目的]初步探讨结核分枝杆菌散在分布重复单位(Mycobacterial interspersed repetitive units)和多位点串联重复序列(variable number of tandem repeats)技术基因分型技术在河南省结核病分枝杆菌基因分型中的应用,初步了解河甫省局部地区MIRU-VNTR基因型种类及其分布.[方法]2007年在河南省的嵩县、新密、扶沟、中牟4个县及南阳市的结核病防治机构实验室分离培养的317株结核分枝杆菌,设计引物,应用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分枝杆菌进行分型检测分析,基因分型聚类分析采用Bio-Numerics软件.[结果]对317株结核分枝杆菌临床分离株的12个MIRU位点检测结果显示明显的基因多态性.经基因聚类分析,可分5个基因群(Ⅰ群、Ⅱ群、Ⅲ群、Ⅳ群和Ⅴ群),292个基因型.其中Ⅰ群占4.7%,含15个基因型;Ⅱ群占67.8%,含198个基因型;Ⅲ群占22.7%,含64个基因型;Ⅳ群1.8%,含4个基因型;Ⅴ群3.5%,含11个基因型.[结论]初步表明河南省结核分枝杆菌MIRUs 基因存在明显的多态性,至少存在5个MIRU型,主要流行型为Ⅱ型.
关键词： 结核病 结核分枝杆菌 基因分型 分枝杆菌散在重复单位 多位点串联重复序列
