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RP11-366L20.3文献资料
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RP11-366L20.3通过NF-κB通路调控E-cadherin表达
目的 研究长链非编码RNA RP11-366L20.3在调控炎症因子表达中的作用.方法 运用脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激THP-1细胞6h,然后收集细胞提取RNA并通过RT-qPCR筛选上调表达的长链非编码RNA,RACE(cDNA末端快速扩增)获取其基因全长,Northern blot验证基因的真实长度和LPS刺激效果,细胞通路抑制剂分析其转录调控通路和胞内分布,过表达和siRNA处理细胞分析RP11-366L20.3调控的下游炎症因子及机理.结果 筛选出一个长链非编码RNA RP11-366L20.3,IPS刺激能上调该基因的表达,RACE扩增全长为833 bp,Northern blot也验证了RACE的实验结果,RP11-366L20.3主要分布于细胞核,其基因的转录受到NF-κB信号通路调控;同时RP11-366L20.3是一个TLR4通路的非编码RNA,过表达RP11-366L20.3能降低E-cadherin的基因表达,而siRNA敲低RP11-366L20.3则能上调E-cadherin的基因表达,RIP实验表明RP11-366L20.3能与P50蛋白直接结合,LPS刺激能增强RP11-366L20.3与p50的结合,从而抑制E-cadherin的基因表达.结论 长链非编码RNA RP11-366L20.3通过NF-κB通路因子P50调控E-cadherin的基因表达.
