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  • 联合应用SSH和cDNA Microarray筛选肺癌相关基因

    作者:范保星;张开泰;笪冀平;谢玲;王升启;吴德昌

    目的利用抑制消减杂交(suppression subtractive hybridization, SSH)和cDNA Microarray筛选肺癌组织、肺癌旁组织和其它肿瘤组织中相互差异表达的基因.方法将利用SSH构建的BEP2D细胞永生化阶段、恶性转化前阶段和恶性转化阶段三个cDNA文库中的克隆制作在一张芯片上,筛选了15例肺癌组织、5例肺癌旁组织和其他癌组织24例(肝癌、胃癌、食管癌、乳腺癌、白血病、子宫内膜癌、脑神经胶质瘤和结肠癌各3例)中mRNA的表达差异.结果获得肺癌组织高于肺癌旁组织表达的cDNA 26个,肺癌旁组织高于肺癌组织表达的31个.二者高于其它8种癌组织的分别为:肺癌旁组织中63个,肺癌组织中87个.结论联合应用SSH和cDNA Microarray是筛选和鉴定不同样本中差异表达基因的快速和有效的方法;肺癌旁组织和肺癌组织中差异表达的基因,以及这二者与其它组织差异表达的基因,不仅可能是肺癌发生发展机制中的重要基因,而且可能是用于肺癌诊断的候选基因.

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