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H9N9亚型文献资料
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一株新的H9N9亚型禽流感病毒的全基因测序及分子特征分析
目的 了解2013年华东地区活禽市场分离的一株H9N9亚型禽流感病毒(命名为:A/chicken/Changzhou/C08/2013)的分子特征,探讨该病毒的出现对新型H7N9亚型禽流感病毒防控的意义.方法 采用高通量测序技术对该分离株进行全基因组测序,MEGA6.0软件进行序列比对,采用邻近归并法(neighbor-joining)构建系统发生树进行基因特征分析.结果 A/chicken/Changzhou/C08/2013血凝素基因(HA)与上海鸡分离株A/chicken/Shanghai/1107/2013 (H9N2)的核苷酸一致性高(99.2％),其HA基因裂解基序为VPSRSSR↓ GLF,呈典型低致病性禽流感病毒(AIV)分子特征;其余的基因则与新型H7N9亚型禽流感病毒的同源性较高(＞99.6％).结论 推测该H9N9病毒是由H9N2亚型AIV与新型H7N9亚型AIV发生重配的新型病毒,其HA基因来源于为H9N2亚型AIV,其他基因来源于新型H7N9亚型AIV,结果提示新型H7N9亚型AIV正在与禽中流行的其他亚型AIV进行重组,需要加强对AIV的持续监测.
