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检测鲜草莓中GⅡ型诺如病毒的两种富集方法比较
目的 建立鲜草莓中GⅡ型诺如病毒(NoV GⅡ)的实时荧光RT-PCR检测方法,评价磁珠富集法和PEG(聚乙二醇)沉淀法对检测草莓中NoV GⅡ的适用性,对北京地区采集的18份草莓样品进行检测.方法 参照ISO/TS 15216-1《实对荧光RT-PCR方法测定食品中甲型肝炎病毒和诺如病毒水平方法》合成检测NoV GⅡ的特异性引物和探针,分别采用磁珠富集法和PEG沉淀法富集病毒,然后提取RNA,建立实时荧光RT-PCR检测方法,并对提取条件进行优化.结果 磁珠富集法的高回收率为1.730%(PBS缓冲液),PEG沉淀法的高回收率为1.682%(TGBE缓冲液),18份草莓样品均未捡出NoV GⅡ.结论 通过磁珠富集法和PEG沉淀法建立的病毒检测的富集方法均适用于鲜草莓中NoV GⅡ的检测.
关键词: 实时荧光RT-PCR 鲜草莓 GⅡ型诺如病毒 磁珠富集法 聚乙二醇沉淀法 -
磁珠富集法分离半夏微卫星序列
目的:利用磁珠富集法分离半夏微卫星序列,以开发半夏微卫星引物.方法:根据链亲和素磁珠和生物素特异结合的特性,将微卫星探针5'端生物素化后与链亲和素磁珠特异结合.用磁珠和探针的结合物与两端连接已知序列人工接头的半夏基因组DNA酶切片段杂交,洗脱未杂交DNA片断后,建立微卫星文库.以此为模板用人工接头序列为引物进行PCR扩增,产物直接克隆,经菌液PCR筛选后测序分析.结果:得到15条半夏微卫星序列,开发效率为93.75%.结论:结果显示这是一种快速而有效的微卫星开发方法.