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云计算在医疗中的应用
这是一个超级计算的时代,在全世界计算技术的应用已从大学和医疗机构广泛地扩展到生命科学公司和政府机构.全球都在持续追求使用计算技术,努力把它用到大程度.云计算概念的产生正是这些努力的一个产物.现在在云计算中,通过网络,以每秒几十亿次来衡量的计算能力可以应用于提供个人医疗信息、计算化学和生物学.
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计算化学在确定天然产物绝对构型中的应用
天然产物所展现出的化学、生物等方面性质与其绝对构型息息相关.对天然产物绝对构型的确定是对天然产物进行全面认识的重要过程.传统的方法存在一定的局限性.然而随着计算机技术及量子化学理论的发展,已能对天然产物的旋光、圆二色谱、核磁共振图谱进行精确的计算模拟.结合了计算与实验光谱的研究方法为确定天然产物绝对构型提供了新的思路.近年来,计算化学手段已经逐渐成为研究天然产物绝对构型的重要工具.本文通过论述近年来计算化学在天然产物绝对构型确定中的研究进展,为研究者合理地选择计算手段用以确定天然产物绝对构型提供参考.
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计算化学方法在基于受体结构的药物分子设计中的基础理论及应用
近年来生物学领域的研究进展极大地加深了对疾病密切相关的靶标分子的结构和功能的认识.然而,如何有效地利用生物大分子的结构信息,进而合理地设计出具有特异性结合活性的小分子药物,还需要进一步开发精确计算受体-配体结合自由能的方法.近年来计算能力迅猛增长及研究大分子体系的理论和算法日趋成熟,基于物理学原理的计算化学方法在药物分子设计中的重要作用日益凸显.本文就计算化学在基于受体结构的药物分子设计中的方法及典型应用实例进行了系统的综述,包括小分子结合位点的成药性评估、化合物数据库的虚拟筛选、先导化合物的结构优化等,同时对目前的应用方法存在的主要问题进行了探讨,提出了切实可行的处理策略.
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利用计算化学方法确定手性化合物立体构型研究进展
在药物研发过程中手性化合物绝对构型的确定是一个极其重要的问题.药物分子的立体构型与药物的疗效、毒性密切相关,因此,药物分子立体结构的研究具有重要意义.目前,手性化合物立体结构的研究方法也倍受关注,运用计算化学方法确定手性化合物的立体构型是一种简便而有效的方法,已经被越来越多的研究者接受并采用.本文对旋光计算、电子圆二色谱(ECD)计算、振动圆二色谱(VCD)计算,以及13C-核磁共振(13 C-NMR)计算等方法进行综述.
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黄连素的提取及分子活性部位研究
黄连素是从黄连、黄柏等中药中提取的生物碱类药物,抗菌疗效确切,主要用于肠道感染,细菌性痢疾等;并具有抗肿瘤,抗癌,降血压等作用.本文采用微型实验方法,从中药黄连叶片中提取黄连素,并参与其质谱实验分析结果,从结构、能量等分子层面上探讨标题化合物可能的分子反应活性部位和机理,以期为研究黄连素的药效作用机理,为药物分子全合成提供理论依据.