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1996-2014年中国HIV-1毒株CRF01_AE亚型传播簇和传播网络研究
目的 了解我国HIV-1毒株CRF01 AE亚型在省内和省际的传播规律和风险因素,为实施精准干预提供参考依据.方法 收集我国19个省份1996-2014年已有的2 094条CRF01_AE pol区基因序列,利用PhyML 3.0软件构建系统进化树,确定传播簇,利用Cytoscape 3.6.0软件构建传播网络,结合背景信息分析传播风险.结果 发现82个传播簇,包含255条序列(12.18％,255/2 094),省内传播簇数量和包含序列数(61个,173条)明显多于跨省传播簇(21个,82条).传播簇中男男性传播人群的成簇比例随时间上升趋势明显,由1996-2008年的2.41％(2/83)上升为2013-2014年的23.61％(72/305)(x2=27.800,df=1,P=0.000).跨省传播簇的男男性传播人群比例明显高于省内传播簇,由1996-2008年的0.67％(2/297)上升为2013-2014年的6.36％(30/472),具有随时间的上升趋势(x2=20.276,df=1,P=0.000).跨省传播簇中男男性传播的比例(86.59％,71/82)明显高于省内传播簇(56.65％,98/173),差异有统计学意义(x2=22.792,P=0.000).含2种及以上传播途径的跨省传播簇的比例(33.33％,7/21)明显高于省内传播簇(13.11％,8/61),差异有统计学意义(x2=4.273,P=0.039).传播网络分析发现,跨省传播簇内高传播风险人群比例(51.22％,42/82)明显高于省内传播簇(26.59％,46/173),差异有统计学意义(x2=14.932,P=0.000).跨省传播簇以男男性传播人群为主.结论 我国HIV-1毒株CRF01_AE亚型存在复杂的传播网络,跨省传播簇快速增长,其中高风险传播者对HIV-1亚型的大范围传播起到重要作用,应深入进行传播网络研究以指导精准干预.
关键词： 艾滋病病毒 CRF01_AE亚型 传播簇 传播网络 -
艾滋病病毒1型CRF01_AE毒株的过去、现在和将来
CRF01 AE是我国目前流行的主要HIV-1毒株,具有独特的流行病学特征.本文从该毒株的发现起源与命名、在国内外的流行过程、参与形成的重组毒株以及致病性等方面进行介绍,并讨论了与流行病学特征密切相关的社会和生物学因素.
关键词： 艾滋病病毒 1型 CRF01_AE亚型 基因亚型 重组 -
1例早期HIV感染者外周血抗体变化和病毒基因序列分析
目的: 观察HIV早期感染者体内的抗体变化特征,为进一步研究HIV感染早期病毒与宿主的相互作用奠定基础.方法:对一名HIV感染者进行流行病学调查、外周血血清学检测、病毒载量和CD4细胞数检测、体外病毒分离,观察该感染者体内免疫学反应及病毒复制特点.使用巢式PCR方法扩增病毒env区C2-V3区基因,通过测序及序列分析观察病毒部分膜区基因特点.结果: 该感染者为早期感染,外周血抗体S/CO值呈逐渐增高趋势,外周血中针对HIV抗原的特异性条带呈逐渐增多趋势,感染183 d后出现针对所有HIV抗原的特异性抗体,病毒载量在感染后3个月时高(18 000 cp/ml),随后下降,从该感染者外周血中分离的病毒毒力较强.基因序列分析显示该病毒为CRF01_AE亚型,与泰国93TH054毒株基因距离近.结论:该感染者体内病毒可能起源于泰国毒株,对HIV早期感染的鉴定为研究我国HIV早期感染者体内病毒进化奠定了基础.
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哈尔滨市HIV-1感染者TRIM5α基因多态性与艾滋病的相关性
目的 分析编码TRI45α蛋白的基因2号外显子单核苷酸基因多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与艾滋病的相关性,并探讨病毒亚型对此相关性的影响.方法 从331例已确诊但未接受治疗的H-IV-1感染者的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中提取基因组DNA,扩增HIV-1病毒的Gag基因和编码TRIM5α蛋白基因的2号外显子基因并获得基因序列信息,统计单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)和构建Gag基因系统进化树图.以CD4+T淋巴细胞数200个/μL为界值将HIV-1感染者分为快速进展组(CD4 ＜200)和慢速进展组(CD4≥200),并分析比较所有331例样本和各HIV-1亚型中TRIM5α基因多态性与艾滋病的相关性.结果 在全部扩增的331条HIV-1的Gag基因中,有239条Gag基因序列与不同的CRF01_AE亚簇聚集,CRF01_AE亚型感染者占所有感染者的72.2％,其他亚型较少,故不进行相关性分析.我们共发现4个SNP位点(-2GC、127CT、334GT和407GA),其中407GG基因型在所有样本和CRF01_AE感染者的快速进展组和慢速进展组中都有明显的统计学差异(P＜0.05),而407GA基因型只在CRF01_AE感染者中有统计学差异.结论 突变位点-2G/C、127C/T、334G/T和HIV-1的感染无相关性,407G/A突变可能与宿主TRIM5α蛋白抗HIV-1的作用增强相关,而HIV-1病毒型别是研究TRIM5α基因多态性和艾滋病相关性应该考虑的因素.
关键词： HIV-1 TRIM5α CRF01_AE亚型 单核苷酸多态性 突变 -
广东省人类免疫缺陷病毒1型CRF01_AE毒株膜区V3环氨基酸序列多态性分析
目的 分析广东省人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)CRF01_AE毒株膜蛋白第三高变区(V3环)氨基酸序列的特点.方法 提取HIV-1 CRF01_AE亚型感染者PBMC中前病毒DNA,巢式PCR扩增HIV-1膜基因c2v3c3区域后测序,对V3环氨基酸序列特征进行分析.结果 73份样本与HIV-1CRF01_AE亚型代表毒株聚集在一起、与其他亚型标准毒株分开,进一步证实本研究73例HIV/AIDS患者感染的HIV-1毒株为CRF01_AE亚型.除6个位点氨基酸一致外,73例病人所有V3环序列的其他29个位点分别有2～8个不同的氨基酸出现;GPGQ为V3环顶端四肽的主要形式,占47.9％,其次为GPGK,占15.1％,四肽中未出现多态性的只有第三位氨基酸;预测HIV-1辅助受体为CCR5的有35例,占47.9％,其次为CXCR4的有34例,占46.6％,两者之间差异无统计学意义(P＞0.05).性传播是广东省CRF01_AE亚型HIV-1感染者的主要感染途径,占54.8％,其次是静脉吸毒,占30.2％.通过性传播途径感染的HIV-1毒株的辅助受体主要为CXCR4,占52.5％,辅助受体为CCR5的占40.0％,两者相比差异无统计学意义(P＞0.05).结论 广东省人类免疫缺陷病毒1型CRF01_AE毒株膜区V3环氨基酸存在较高的多态性,使用CCR5及CXCR4为辅助受体的HIV-1毒株比例相近.
关键词： 人类免疫缺陷病毒1型 CRF01_AE亚型 V3环 序列分析
