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  • 超重与肥胖症的流行趋势与行为治疗新进展

    作者:孙晶丹;蔡永江;邵桂霞

    肥胖症是一个基因高感者在环境因素(高脂高热量饮食、体力活动减少及心理障碍等)作用下,引起体脂调控网络的神经内分泌调节紊乱所致的疾病.肥胖症既是一个独立的疾病,又是2型糖尿病、心血管病、高血压、中风和多种癌症的危险因素,被世界卫生组织列为导致疾病发生的十大危险因素之一.肥胖症目前在全世界呈流行趋势,每年肥胖症造成的直接或间接死亡人数已达30万,成为仅次于吸烟之后的第2个可以预防的致死危险因素,与艾滋病、吸毒、酗酒并列为世界性四大医学社会问题.肥胖、高血压、高血脂与高血糖称为"死亡四重奏",并有可能成为21世纪的头号杀手.因此,WHO向全世界宣布:"肥胖症将成为全球首要健康问题"[1].

  • 胃癌转录调控网络构建及预后相关转录因子分析

    作者:康争春;李勃;蔡慧;马立业;于恩达

    目的 构建胃癌转录调控网络,分析预后相关转录因子.方法 首先用基因芯片数据构建差异表达转录因子在癌组织中的共表达网络,进而发现共表达网络中的核心亚网络,然后用具有预后数据的合适表达谱芯片,根据构建的网络筛选预后相关的转录因子,采用样本量较大、有预后数据的表达谱芯片验证转录因子对胃癌患者预后是否有预测作用.结果 共发现4个核心网络、21个核心转录因子.结合转录因子核心网络,确定和预后相关的4个核心转录因子其中的3个和患者预后相关.结论 构建胃癌转录调控网络可为研究胃癌的潜在调控机制提供参考,并可能为将来胃癌的诊断治疗提供分子标志物及靶点.

  • miRNA调控网络的遗传变异研究进展

    作者:郭臻;周宏灏;张伟

    微RNA(microRNA,miRNA)是新发现的一类进化上高度保守的重要转录后调控因子,通过调节基因表达而参与调控细胞凋亡、增殖及分化等生理过程,同时与肿瘤等疾病的发生发展密切相关.近年来研究发现,miRNA、miRNA生物合成通路基因及miRNA靶基因结合位点遗传变异可影响miRNA调控功能的发挥,并产生显著的遗传学效应.miRNA调控网络遗传变异可导致miRNA功能缺失或增加,影响成百上千基因的表达.越来越多研究表明miRNA多态与疾病发生发展及预后密切相关.miRNA调控网络遗传变异不论对于复杂性疾病发病机制研究,还是诊疗预后分子标记物的确定,都具有极其重要的研究价值.

  • 链霉菌自动调控因子的研究进展

    作者:吴杭;张部昌;马清钧

    γ-丁酸内酯自动调控因子是一种由链霉菌产生的被称为微生物"激素"的小分子化合物,它控制着链霉菌次级代谢物的产生或形态分化.根据该类自动调控因子C-2位细微的结构差别分为三种类型,分别为A因子型、VB型和IM-2型.本文详细介绍了每种类型中具有代表性的自动调控因子、受体及其对链霉菌次级代谢与形态分化的调控作用,并系统地阐述了其调控网络.

  • 姜黄素诱导肿瘤细胞凋亡的信号途径研究进展

    作者:苗久旺(审校);张钦德

    姜黄素(curcumin)是姜科姜黄属植物根茎中所含的主要有效成分,药理作用广泛,如抗炎、抗氧化、抗肿瘤、抗动脉硬化、清除自由基、降血脂等。姜黄素的抗肿瘤活性于1985年由自印度学者Kuttan等首次提出,至今已由大量文献证实,其具有作用明确、抗瘤谱广、毒性小等优点[1]。姜黄素具有很强的凋亡诱导能力,诱导细胞凋亡是其抗肿瘤作用的重要机制,涉及一系列复杂的生物学过程,并受细胞内外多种途径及信号分子调控,不同的途径所表现的形式不同,它们之间有交叉、有重叠,构成了错综复杂的调控网络,现对其诱导细胞凋亡的主要信号途径综述如下。

  • 基于生物信息学方法预测hsa-miR-181a在脑卒中发病中的分子调控网络

    作者:吕燕妮;钱贻崧;付龙生

    目的 运用生物信息学方法预测固有免疫信号分子hsa-miR-181a与脑卒中相关的分子调控网络.方法 运用UCSC基因组浏览器、人类miRNA疾病数据库、TF-miRNA调控数据库、miRNA靶基因预测验证数据库、Genecards数据库、长链非编码RNA (LncRNA)疾病数据库、DLANALAB-LncBase数据库、转录因子结合谱数据库,研究hsa-miR-181a的上游转录因子,下游靶基因及与其相互作用的LncRNA间的多个调控途径,绘制hsa-miR-181a的核心调控网络图.采用脂多糖(LPS)刺激慢病毒感染的BV2小胶质细胞,采用实时定量PCR检测Toll样受体4(TLR4)、肿瘤蛋白63(p63)、miR-181a和核因子κB p65(NF-κBp65)的水平变化,对hsa-miR-181a调控网络进行验证.结果 UCSC数据库中显示hsa-miR-181a有2个亚型,在多个物种中具有高度保守性.通过疾病分析及文献调研发现hsa-miR-181a与多种疾病密切相关,尤其是缺血性疾病.信息学分析显示hsa-miR-181a受转录因子p63调控的同时,又调控着下游靶基因,脑源性神经营养因子(BDNF)、TLR4等58个基因.此外,Lnc RNA CDKN2B-AS1的转录和其锌指转录因子Snml、n-MYC也可能与hsa-miR-181a存在相互作用.所有基因构成一个以hsa-miR-181a为核心的调控网络,在脑卒中的发生与发展中起着重要作用.在LPS刺激的BV2细胞中,TLR4、p63、miR-181a水平升高,而RNA慢病毒技术干扰小胶质细胞中的p63的表达后,p63表达降低,miR-181a水平也降低,下游NF-κB p65水平被抑制,表明p63是TLR4调节miR-181a表达的关键信号分子.结论 生物信息学方法预测并初步验证了hsa-miR-181a分子在脑卒中疾病中的调控网络,为深入研究提供了理论支持.

  • 牙囊干细胞成骨分化基因调控网络的生物信息学分析

    作者:王睿;麻鹏;李凌志;郭建青

    目的:应用生物信息学分析牙囊干细胞(DFSCs)成骨分化过程中基因调控网络。方法:从 GEO Datasets 数据库获取在 DFSCs 成骨分化过程中差异表达的基因。应用 DAVID 和 GeneMANIA 数据库对这些基因的关系进行分析。结果:从 GEO Datasets 数据库获得了大量 DFSCs 成骨分化过程中差异表达的基因,对差异表达明显(P <0.05)的289个基因进行分析,富集到“细胞分化”、“细胞增殖”、“骨骼系统发育”、“钙信号通路”等基因子集。其中 ALPL、CTSK、TUFT1、TGFBR2、FHL2、ROR2、STC1、POSTN,ZBTB16、FRZB、PRELP、IGFBP5等12个基因被富集在“骨骼系统发育”子集,这12个基因通过共表达、共定位、遗传学相互作用等彼此关联并与其它信号通路相联系。结论:DFSCs 成骨分化中许多差异表达的基因间存在相互作用的分子网路。需要从 WNT、TGFbeta、MAPK 等信号通路、同源盒转录因子及成骨分化标记物基因的整体关系上来认识 DF-SCs 成骨分化。

  • 肿瘤代谢研究进展综述

    作者:阮丹

    肿瘤细胞重要的生物学特征是无限制的快速增殖,为了满足其快速增殖的需要,肿瘤细胞表现出与正常组织细胞不同的代谢特征.早在1924年Otto Warburg就发现肿瘤细胞在葡萄糖的利用上与正常细胞不同,即肿瘤细胞更喜欢将葡萄糖进行糖酵解转变为乳酸,而不是像正常细胞那样经三羧酸循环(TCA cycle)由线粒体氧化磷酸化产生三磷酸腺苷(ATP),即使在氧气充足的情况下也是如此.早对此现象的解释是Warburg本人于1956年提出,他认为肿瘤细胞线粒体的某些缺陷导致厌氧呼吸及续发的对糖酵解的依赖,而后来研究者发现在大多数肿瘤细胞中线粒体的功能并未受损,说明Warburg现象是由其它原因造成的.随着人们对肿瘤研究的逐步深入,肿瘤细胞的代谢途径及其调控已经得到初步阐明.本文将从肿瘤细胞的代谢特征及生物学?解释肿瘤代谢的调控网络,基于肿瘤代谢的肿瘤预防和治疗等方面对该领域的研究进展综述.

  • 新生儿血清脂联素水平变化及其临床意义

    作者:田朝霞;董红红

    脂联素(adiponectin)是近年来发现的由脂肪细胞分泌的一种蛋白质类激素,是机体脂质代谢和血糖稳态调控网络中重要的调节因子,它通过内分泌、旁分泌和自分泌方式参与调节能量代谢[1].本研究采用放射免疫法测定新生儿血脂联素水平及其动态变化,探讨脂联素在胎儿、新生儿生长发育过程中的作用.

  • 基于Cytoscape的miRNA调控网络的构建与研究

    作者:杨淼;杜菁;李冬果;杨秋英;刘文艳;姚红串

    目的:建立乳腺癌生物标志物微小核糖核酸(miRNA)预测靶基因的调控网络,对靶基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库通路分析.从生物信息角度,为乳腺癌的治疗提供一定的理论指导.方法:从已发表文献获取乳腺癌的生物标志物miRNA,借助5个预测工具预测出miRNA靶点.使用Cytoscape分析软件建立miRNA的预测靶基因调控网络,分别使用生物网络基因本体论工具(BiNGO)插件和miRWalk数据库对调控的靶基因进行GO富集分析和KEGG通路分析.结果:构建一个包含801个节点、791个靶点及1062对调控关系的乳腺癌生物标志物miRNA的预测靶基因调控网络,GO分析靶基因在生物学过程中显著富集.KEGG通路分析中,得到85个富集的信号通路,以及7个与乳腺癌有关的信号通路.结论:从生物信息学角度,通过分析miRNA靶基因的GO富集和KEGG信号通路,为靶基因的生物学功能研究提供理论指导,有助于为乳腺癌治疗提供可靠靶点.

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