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EMA-荧光定量PCR文献资料
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四种检测方法用于上海市口岸管道水军团菌存在状况调查的研究
目的 比较传统的平板培养法、普通聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)、实时荧光定量PCR(realtime fluorescence quantitative PCR,real-time PCR)和荧光染料叠氮溴化乙锭(ethidium monoazide,EMA)结合荧光定量PCR的方法(EMA-荧光定量PCR)对管道水中军团菌的检测效果.方法 于2010年对上海市2个口岸管道水进行采样,共采集132份.分别采用传统的平板培养法、普通PCR、荧光定量PCR和EMA-荧光定量PCR对水样中军团菌进行定性和/或定量分析.结果 对132份管道水标本进行军团菌定性检测,平板培养法、普通PCR、荧光定量PCR和EMA-荧光定量PCR检出军团菌污染率分别为18.9％、20.5％、24.2％和24.2％.3种定量方法(平板培养法、荧光定量PCR和EMA-荧光定量PCR)对阳性标本中军团菌定量数值分别为50～ 1320菌落形成单位/升(cfu/L)、20～13 085基因单位/升(GU/L)和10～4480 GU/L.对于132份水样,3种方法对军团菌含量分析的定量数值大小差异有统计学意义(x2=193.6,P＜0.01),其中荧光定量PCR的定量数值高,EMA-荧光定量PCR的数值次之,平板培养的数值低.结论 上海市口岸管道水中军团菌污染率和含菌量高.荧光定量PCR和EMA-荧光定量PCR方法检测管道水中军团菌的灵敏度优于传统的培养方法,EMA-荧光定量PCR方法适合用于环境水体中军团菌活菌监测.
关键词： 军团菌 管道水 实时荧光定量聚合酶链反应 EMA-荧光定量PCR
