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一起札如病毒所致成年人急性胃肠炎暴发的分子流行病学研究
目的 了解一起成年人急性胃肠炎暴发流行的病原学.方法 采用国家标准方法对样本进行沙门菌、志贺菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、副溶血弧菌、变形杆菌、致泻性大肠埃希菌、蜡样芽孢杆菌、空肠弯曲菌及单核细胞增生李斯特菌10种致病菌进行检测.采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测诺如病毒和札如病毒核酸,对阳性PCR产物进行核苷酸序列测定,并进行基因系统进化分析.结果 7份粪便样本中4份为札如病毒核酸阳性.4株札如病毒与GⅠ.2型参考株核苷酸序列司源性在94.7％～98.4％之间.基因进化分析显示,札如病毒深圳株与Sapovirus Hu/Oshimal/2009/JP、Houston/90 (U95644)、Parkville/94/U73124在同一进化树遗传分支,属于GⅠ.2型.结论 此起成年人急性胃肠炎暴发是由札如病毒GⅠ.2型感染所致.
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2014～2017年南京地区胃肠炎暴发中诺如病毒分子流行病学特征
了解2014～2017年南京地区诺如病毒胃肠炎暴发流行特征、变化规律和流行株特征,为疫情控制、疫苗研发提供科学依据.收集2014年9月至2017年8月南京地区12个区疾控上送85起疑似诺如病毒急性胃肠炎暴发样本,应用荧光定量PCR和一步法RT-PCR检测诺如病毒基因序列,测序后利用分子生物学软件对序列进行分析.其中66起诺如病毒检测阳性,暴发集中于幼儿园和小学,冬春季节高发.诺如病毒优势株在连续的几个流行季持续变化,由GⅡ.4/Sydney 2012转变为新型GⅡ.P17-GⅡ.17,再到GⅡ.P16-GⅡ.2.其中GⅡ.P16-GⅡ.2与全球2016～2017年参考株同源性达98.4％～99.5％.2014～2017年南京地区诺如病毒急性胃肠炎暴发的流行强度呈上升趋势.引起暴发的诺如病毒以GⅡ为主,含多种基因型,并存在重组株,优势基因型在连续的几个流行季持续改变.诺如病毒近几年不断变异,从而逃脱人群免疫,可能是其流行趋势上升的原因之一.
