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铁皮石斛居群差异的研究Ⅱ ISSR指纹标记方法的建立与优化
目的:针对铁皮石斛ISSR的反应特点,建立稳定可靠的ISSR分子指纹标记反应体系,为进一步研究铁皮石斛的居群差异奠定基础.方法:通过筛选引物并设定影响铁皮石斛ISSR反应的诸因子的不同浓度,检测ISSR不同反应体系的扩增效果;通过分析非特异性条带的产生原因并进行条件优化,建立铁皮石斛ISSR稳定可靠的反应体系.结果与结论:首次建立了可用于铁皮石斛ISSR-PCR分析的适宜的反应体系:25 μLPCR反应体系中,10×Taq酶配套缓冲液,1.5 U Taq DNA聚合酶,1.2~1.8 mmol·L-1 MgCl2,80 μmol·L-1 dNTP,0.2μmol·L-1引物,DNA模板约20 ng,退火温度52~60℃;实验表明:Taq酶质量、DNA模板品质、退火温度等对ISSR反应结果具有较大影响.所建立的铁皮石斛ISSR反应体系具有标记位点清晰、反应系统稳定、检测多态性能力较强、重复性好等特点,可以较好地应用于铁皮石斛的居群鉴别及居群分子生态的研究.
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马氏田口两种不同方法的比较研究
马氏田口是研究多元系统的一种新方法,它通过建立与优化测量表,测量观测值的异常程度,并进而采取相应的有效措施.
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何首乌ISSR-PCR反应体系的建立与优化
目的 建立和优化ISSR-PCR反应体系.方法 通过单因素实验研究ISSR反应体系中主要成分(模板、Taq DNA聚合酶、Mg2+、引物、dNTPs)以及退火温度对扩增结果的影响.结果 建立了适合何首乌ISSR分析的反应体系和扩增程序,即在25μl反应体系中,内含1×Taq酶配套缓冲液、100ng模板、1.5 U Taq DNA聚合酶、1.5 mmol/L Mg2+、0.6μmol/L引物、0.2 mmol/L dNTPs.扩增程序为94℃预变性5 min;然后是94℃变性45s,(据不同引物的退火温度)复性1 min,72℃延伸1.5 min,共35个循环;72℃延伸7 min,4℃保存.结论 这一优化体系的建立为今后利用ISSR标记技术进行何首乌鉴定及种质资源遗传多样性分析提供了一个标准化程序.
关键词: 何首乌 简单重复序列区间扩增多太性 反应体系 建立与优化