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静脉注射吸毒感染者体内HIV-1 CRF07_BC的准种变异特征
为了研究静脉注射吸毒者(IDU)体内HIV-1 CRF07_BC病毒准种变异和遗传多样性特征,本文采用单基因组扩增(SGA)技术分别从6份CRF07 BC感染者血浆获得HIV-1病毒准种env基因gp120片段序列11～28条,采用构建系统进化树的方法进行聚类分析,描述感染者血浆中CRF07_BC病毒准种的变异特征;运用Simplot软件、分段系统进化树和对平均两两比对基因距离进行遗传多样性作图(Diversity plot)的方法分析病毒准种间的重组.系统进化树分析结果显示仅1个病例具有较高的遗传同质性,而其他5个病例的遗传异质性较高,主要表现为系统进化树上形成2～4个次级进化簇.此外,有3个病例存在病毒准种间的重组.本研究表明SGA技术能有效地分析感染者体内病毒准种复杂的变异特征.
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慢性乙型肝炎患者抗病毒治疗中的病毒准种演变
目的 探讨拉米夫定耐药后换用恩替卡韦补救治疗的慢性乙型肝炎患者的病毒准种演变.方法 提取1例慢性乙型肝炎患者治疗中的7个不同时间点(0、24、48、60、72、96、152周)血清中的HBV DNA,巢式聚合酶链反应法扩增HBV DNA聚合酶基因逆转录酶区,克隆测序法对逆转录酶区氨基酸替换形式及准种分布进行分析,并采用扩增耐药突变系统聚合酶链反应法对患者病毒种群中野毒株与病毒总量进行定量检测.结果 患者在治疗过程中主要存在rtM204V、rtL180M+rtM204V和rtM204I 3种拉米夫定耐药相关的病毒株变异形式,各病毒株所占比例不断发生变化,基线时HBV野毒株为优势病毒株,在病毒学突破时,种群中全部为耐药突变株;换用恩替卡韦治疗后,随着病毒载量的下降,拉米夫定耐药突变株被抑制,野毒株在种群中比例逐渐上升,并成为优势病毒株(79.3%).扩增耐药突变系统聚合酶链反应检测结果显示,在基线和发生病毒学突破时,野毒株在种群中的比例分别为68.55%和0.21%,换药治疗后24周,野毒株比例开始上升,此后野毒株占种群的比例波动于16.01%～26.93%.结论 慢性乙型肝炎患者在核苷(酸)类药物序贯治疗过程中,HBV种群的准种分布一直处于动态变化中.不同的HBV准种演变模式可能在恩替卡韦补救治疗中对恩替卡韦耐药发生的作用也不相同.
