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赛鸽文献资料
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一株赛鸽源鸽圆环病毒全基因克隆与序列分析
鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)是圆环病毒科的一个成员,是一种免疫抑制性病原.为了研究PiCV中国流行毒株的基因特征和遗传进化关系,本研究应用PCR方法对江苏省某赛鸽公棚的22份样品进行了PiCV检测,结果有6份样品为阳性.采用重叠PCR技术得到一株鸽圆环病毒全基因序列,命名为JS15-1(GenBank登录号:KX431143).基因序列分析表明,JS15-1全长为2 034bp,包含3个主要开放阅读框.核苷酸同源性比较结果显示JS15-1与GenBank上登录的其他鸽圆环病毒分离株的全基因核苷酸同源性为85.3％～97.1％,与比利时分离的Bel20株同源性高.不同鸽圆环病毒Rep基因同源性为92.1％～96.6％,Cap基因同源性为72.2％～99.4％.全基因遗传进化树显示JS15-1与之前的中国分离株处于不同的分支,而与Bel20的亲缘关系近,Rep基因进化树显示JS15-1与Bel20、PiCV/Japan/2010、lta4B位于同一分支,Cap基因进化树显示JS15-1与Bel20处于同一分支,亲缘关系近.氨基酸序列比较发现,JS15-1与Bel20在Rep蛋白存在6个氨基酸残基的差异,而Cap蛋白存在1个氨基酸残基的差异和1个氨基酸残基的插入.研究结果表明,JS15-1极可能来源于比利时,而且发生了变异.
关键词： 鸽圆环病毒(PiCV) 赛鸽 基因 遗传进化分析
