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上海出入境检验检疫局发现我国首例库波热病毒
针对西非安哥拉回国的不明原因发热病人,筛查其可能携带的传染病病原体.采用荧光PCR的方法对口岸重点关注的黄热病毒、寨卡病毒、登革病毒等病原体进行筛查;采用深度测序的方法,搜索病毒库、细菌库、寄生虫库,进行序列比对筛查各类病原体,采用全基因组测序的方法获得病原体全基因组序列.2017年1月2日凌晨1点,上海出入境检验检疫局国家国境口岸卫生监督检测重点实验室接到一份紧急样本,样本来自1名安哥拉回国的28岁男子.该男子在安哥拉当地医院初筛黄热病阳性,该男子要求自行回国治疗.针对病人的血液样本和尿液样本,开展黄热病毒、登革病毒、寨卡病毒、裂谷热病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒、流行性乙型脑炎病毒、疟原虫等多种虫媒病原体的荧光PCR检测,结果显示阴性.通过对血液样本的深度测序发现,该病人感染了一种新型的弹状病毒,中文命名为库波热病毒,并获得了库波热病毒全基因组序列,与尼日利亚发现的库波热病毒比较,同源性为96%.
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弹状病毒的分类和进化
弹状病毒科病毒给人类健康、农业、畜牧业和渔业带来重大影响.不同属病毒之间在基因组结构、宿主范围、传播方式等方面性状各异.目前弹状病毒划分为9个属,但仍有不少新发现病毒有待分类.病毒的进化与媒介(宿主)、传播方式、生态环境等多种因素密切相关.
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海南岛库蚊和伊蚊基因组弹状病毒核蛋白内生病毒片段的鉴定和特征描述
目的 鉴定和特征描述海南岛蚊子基因组弹状病毒核蛋白内生病毒片段.方法 收集海南岛内的库蚊、伊蚊和按蚊,分别提取各类蚊子的总基因组,以此为模板PCR扩增弹状病毒类核蛋白内生病毒片段,并通过测序和分子生物学方法对其特征进行鉴定和描述.结果 在海南岛库蚊和伊蚊基因组中获得弹状病核蛋白内生病毒片段,采用测序和分子生物学方法分析和鉴定了该内生病毒片段在进化上高度保守.结论 数据分析证明蚊子基因组弹状病毒核蛋白内生病毒片段与弗兰德斯病毒(Flanders virus)相关,这种病毒在海南岛还没见报导过;初步表明蚊子基因组弹状病毒核蛋白内生病毒片段是在蚊子扩散到海南岛来之前就已经整合到蚊子基因组当中的.