您当前的位置：
首页 > 文献资料
所属专业：
反转录聚合酶联反应(RT-PCR)文献资料
-
传染性法氏囊病病毒中国强毒株A节段cDNA基因的克隆和序列分析
以来自哈尔滨传染性法氏囊病病毒(IBDV)强毒株(Harbin毒株,H)的基因组RNA为模板,用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)的方法得到了其A节段的全长cDNA片段,分5＇端(1 659bp)和3'端(1 444bp)上下两段分别克隆到pGEMB®-T载体上,测定了其核苷酸顺序,在长为3 101 bp中含有两个阅读框ORF A1和ORF A2,分别编码1 012个氨基酸的前体蛋白(VP2-4-3)和145个氨基酸的VP5,ORF A1和ORF A2有部分的重叠.将核苷酸序列及推测出的氨基酸序列与已报道的IBDV血清Ⅰ型和Ⅱ型毒株的相应序列进行了比较,结果表明:H毒株与其它血清Ⅰ型毒株之间,在核苷酸水平上存在25bp-267bp的差异;在氨基酸水平上存在17～40个氨基酸的差异.在VP2-4-3内比较显示,H毒株与P2、Cu-1之间氨基酸的差异小为1.7%,H毒株与UK661之间氨基酸的差异大为3.9%.变异主要发生在VP2的可变区(206-350位氨基酸),在H毒株所特有的12个氨基酸当中,该区就占5个,代表1.76%的变异.VP4、VP3和VP5区各有两个特有氨基酸的替代,分别代表0.74%、0.69%和1.38%的变异.序列分析显示,H毒株在抗原性和毒力上均存在着变异,然而,它既不同于欧洲、日本和以色列分离的超强毒,也不同于美国的变异株.与其亲缘关系近的是欧洲的较早期的分离株,但是在可变区,尤其是在两个亲水区又有明显的突变.
