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  • 基于次生特征提取方法预测蛋白质同源寡聚体

    作者:李启鹏;张绍武;潘泉;陈伟

    寡聚蛋白质相对于单体蛋白质具有许多优势,广泛地参与多种生命活动.本文提出次生特征提取方法 , 使用支持向量机作为分类器, 采用" 一对一"的多类分类策略, 基于蛋白质一级序列提取特征方法 ,对四类同源寡聚体进行分类研究.结果 表明, 在Jackknife检验下, 基于次生特征和氨基酸组成成分特征构成的特征集, 加权情况下,其总分类精度高达到了78.41%, 比氨基酸组成成分特征提高13.09%,比参考文献好特征集BG提高了6.86%,比好原生特征集CM1提高了5.53%.此结果 说明次生特征提取方法 对于蛋白质同源寡聚体分类是一种非常有效的特征提取方法 .

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