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单殖吸虫分子系统学研究进展
单殖吸虫为一类主要寄生于水生脊椎动物体外的蠕虫,已报道3 000余种.本文回顾了单殖吸虫传统分类学研究概况,并从目标基因的选择、分子分类和分子系统学研究3个方面概述了单殖吸虫分子系统学研究进展,进而对分子系统学与传统形态分类学的关系及其研究前景进行了阐述.
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基因序列在原虫分子系统学中的应用
原虫中可能包含核基因、线粒体基因、质粒基因、RNA基因等.其中核基因、线粒体基因等基因由于进化速率相对恒定,并具有进化的保守性,可作为衡量不同进化单位亲缘关系的指标,常用于原虫系统发生的研究.本文重点综述了核基因中的18S rRNA基因、ITS序列、β-tubulin基因、Actin基因、TRS序列和线粒体基因中的Cytb基因、HSP70基因及kDNA等在原虫分子系统学中的应用,为这些基因的进一步研究提供参考.
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动物线粒体DNA的特异结构及应用分子系统学分析的方法
动物线粒体是一种存在真核生物细胞质中的细胞器,根据已经测序的动物线粒体DNA,它可编码13种蛋白质,2种rRNA,22种tRNA,和非编码区(D-Loop),已有报道发现了新的R-Loop结构,呈现母性遗传特点,且其平均进化速度是核基因组的10倍,尤其是D-Loop区.同时在线粒体DNA控制区中发现的重复序列在种间甚至种内存在着差异可作为动物特异的分子标记.根据线粒体的结构和遗传特点,借助生物信息学手段和丰富的数据库资源,对动物种间及种内群体进行分子系统学的研究,并确定分类地位,亲缘关系.
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湖北钉螺遗传多样性及其分子系统学研究进展
湖北钉螺(Oncomelania hupensis)在中国、日本、菲律宾和马来西亚等亚洲国家与地区都有分布,是日本血吸虫的惟一中间宿主,在血吸虫病流行中起着极其重要的作用.在我国大陆,钉螺主要分布于长江以南的12个省、市、自治区,至2002年全国共有钉螺面积351 885.06 hm2[1].湖北钉螺不仅在我国分布较广,而且在形态学、遗传学以及钉螺对血吸虫易感程度等方面存在着地域上的差异[2,3].对湖北钉螺亚种的分类,多年来一直存在争议[4-6],以前主要是依据钉螺的形态特征、地理分布、生态环境和对寄生虫的易感性等方面进行分类[2,7].
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RNA二级结构在分子系统学中的应用
分子系统学是以生物大分子为标志,对生物的鉴定、遗传演化和种间亲缘关系开展研究的新兴领域,并将成为今后生物系统学研究的热点.
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分子系统学在真菌分类命名中的应用与进展
真菌分子系统学以分子生物学、遗传学和生物信息学为手段,以分子水平对真菌进行种属识别,与传统的表型分类系统相比,更为可靠、高效,极大地推动了真菌分类学的发展.因此,真菌分类学正处于一个划时代的转变时期,即由表型分类向基因型分类的转变,以形态学为基础的种属概念向以分子系统学为基础的种属概念转变.综合论述了分子系统学在真菌分类和命名中的应用,并介绍近年来真菌分类和命名方面的变化和进展,供国内科研和临床工作者参考.