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戈登菌mmpL3同源基因序列分析及功能预测
目的 分析支气管戈登菌临床株mmpL3 (Rv0206c)同源基因(Gbro4481)序列,并预测其蛋白质结构及功能,为Gbro4481蛋白的进一步研究奠定基础. 方法 根据全基因组测序结果和同源比对找到支气管戈登菌的mmpL3同源基因,应用expasy工具预测支气管戈登菌MmpL3同源蛋白理化性质;利用Interproscan和Gene ontology工具对蛋白保守序列和功能进行预测;使用TMHMM在线工具进行拓扑结构预测. 结果 筛选出MmpL3同源蛋白(Gbro4481),该蛋白含有2个膜转运蛋白结构域和1个固醇敏感多肽区;TMHMM预测Gbro4481蛋白有10个跨膜区. 结论 支气管戈登菌的Gbro4481蛋白与结核分枝杆菌H37Rv的mmpL3蛋白同源,是分枝菌酸的转运蛋白,参与胞内小分子的运输和信号转导.
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1例L型支气管戈登菌肺部感染的报道
放线菌目戈登菌属支气管戈登菌存在于环境中,在机体免疫力下降时可感染致病.从1例肺部感染4年的78岁患者痰标本中分离出1株菌株,经聚合酶链反应(PCR)扩增16S rRNA DNA,序列比对分析证实为支气管戈登菌.该菌株在含蔗糖的Middlebrook 7H9(7H9-L)半固体培养基上呈煎蛋样嵌入性生长,在含氯化钠的92-3TB(92-3 TB-L)液体培养基也生长,而在罗氏培养基、 BACTEC MGIT-960、不含氯化钠的92-3 TB(92-3 TB-B)液体培养基及不含蔗糖的Middlebrook 7H9(7H9-B)半固体培养基不生长.涂片抗酸染色显微镜下可见大小不等的抗酸染色阴性球状或短杆状菌.传代培养2代后可见橘红色菌落,涂片抗酸染色可见少量抗酸染色弱阳性杆状菌,革兰染色及扫描电子显微镜观察菌体为杆状.结果表明,从患者痰液中分离的菌株为L型支气管戈登菌,提示肺部感染迁延不愈的免疫力低下患者需考虑感染L型支气管戈登菌的可能.
