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  • 弓形虫Toxofilin蛋白基因克隆和生物信息学分析

    作者:王利磊;杨琰琰;王洪法;刘源璟;刘功振

    目的 运用生物信息学方法预测分析弓形虫Toxofilin基因编码蛋白的功能域及三级结构. 方法 PCR扩增Toxofilin全长基因序列,利用SignaIP和TMHMM在线网站预测分析其编码蛋白的信号肽、跨膜区;利用DNAStar软件分析Toxofilin蛋白的亲水性、抗原指数;联合运用ExPASY和PRODATA分析Toxofilin蛋白的功能域及三级结构. 结果 PCR扩增Toxofilin基因大小为738 bp.DNAstar分析其编码蛋白Toxofilin序列存在典型信号肽,但不存在跨膜区,在其N端存在较高的亲水性基团和抗原指数.ExPASY分析Toxofilin蛋白存在酰基化、磷酸化蛋白激酶位点. 结论 Toxofilin蛋白含有信号肽和磷酸化位点等功能域,抗原指数,为验证Toxofilin功能奠定了理论基础.

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