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结核分枝杆菌Rv2629基因编码蛋白的生物信息学分析
目的 应用生物信息学方法分析结核分枝杆菌Rv2629基因编码蛋白的结构和功能. 方法 从NCBI GenBank中获得结核分枝杆菌H37Rv利福平敏感菌株Rv2629的基因序列,利用在线分析软件预测和分析其编码蛋白的理化性质和亲疏水性,跨膜结构域及信号肽,糖基化位点及磷酸化位点,二级和三级结构及B、T淋巴细胞抗原表位. 结果 Rv2629蛋白由374个氨基酸组成,具有亲水性,主要存在于细胞壁及细胞膜.Rv2629含有信号肽及跨膜结构域,6个糖基化位点和4个磷酸化氨基酸位点,二级结构中α螺旋约占45.72％,β折叠约占17.11％.该蛋白含有3个潜在的B细胞抗原表位,其优势抗原表位主要集中在67-70,91-95,229-232位氨基酸,4个CTL细胞表位分别位于279、283、98、346位氨基酸,11个Th细胞表位分别位于26、127、256、25、34、116、204、215、350、363、367位氨基酸. 结论 Rv2629蛋白存在于细胞壁及细胞膜,是一分泌蛋白,在结核病的潜伏期可上调表达.该蛋白含有B、T细胞抗原表位,可作为结核利福平耐药株的研究靶点.
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结核分枝杆菌Rv2629基因产物的亚细胞定位和穿梭质粒转化耻垢分枝杆菌
目的 研究结核分枝杆菌利福平耐药相关蛋白Rv2629在细胞内的亚定位及其与药敏的相关性.方法 采用差速离心进行细胞组分分离及蛋白质印迹法(Western blot)检测初步判定蛋白亚细胞定位;采用pMV261转化耻垢分枝杆菌,BACTEC MGIT 960测定转化菌株的利福平耐受性.结果 Rv2629蛋白主要定位于结核分枝杆菌的细胞壁和细胞膜,重组有Rv2629突变位点191C质粒的耻垢分枝杆菌对利福平的低抑菌浓度(MIC)为160mg/L,相应的携带有野生型基因191A的宿主菌MIC为20 mg/L.结论 Rv2629基因191A/C突变同利福平耐药相关.
关键词： 结核分枝杆菌 Rv2629 亚细胞定位 穿梭质粒pMV261 药敏试验
