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转录谱表达文献资料
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环丙沙星对肠致病性大肠埃希菌转录谱基因表达的影响
目的 探讨不同浓度环丙沙星对肠致病性大肠埃希菌转录基因表达的影响.方法 在肠致病性大肠埃希菌对数生长期加入不同浓度环丙沙星(高浓度组4 μg/ml,低浓度组2 μg/ml),对照组加入生理盐水,分别于0、45、90、135和180 min时收集菌液,提取细菌总RNA,使用表达谱芯片检测环丙沙星作用后肠致病性大肠埃希菌在转录过程中的基因变化,分析各时间点大肠埃希菌转录水平差异;筛选差异基因,采用荧光定量PCR验证差异基因表达.结果 与生理盐水组比较,4 μg/ml环丙沙星组大肠埃希菌共有1 724个基因转录上调,1 806个基因转录下调,2μg/ml组中共有988个基因转录上调,2 297个基因转录下调.在表达差异的基因中,以编码假设合成蛋白及转录调控蛋白基因数多.两组中有共性的基因为21个,这些基因在不同浓度及所有的5个时间点均下调表达,表达的基因包括编码ABC转运膜蛋白基因和菌毛蛋白基因.在2 μg/ml与4μg/ml组的对比中,未观察到环丙沙星影响肠致病性大肠埃希菌致病岛毒力基因的表达差异(P＞0.05).差异表达的基因通过荧光定量PCR检测均有统计学意义(分别与生理盐水组比较,P＜0.05).结论 不同浓度环丙沙星体外对肠致病性大肠埃希菌毒力基因转录的影响无显著性差别,但对耐药相关基因转录具有显著影响,这些影响是否与对肠致病性大肠埃希菌对环丙沙星耐药有关仍需进一步研究.
