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CoxB4病毒文献资料
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柯萨奇病毒B组4型河南分离株VP1区基因特征分析
目的 了解河南省手足口病病原柯萨奇病毒B组4型(CoxB4) VP1区基因特征,并比较不同疾病来源CoxB4病毒分离株VP1区异同.方法 对采集的手足口病患者临床标本134份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过设计CoxB4病毒VP1区特异性引物,对8株病毒进行PCR扩增,用生物学软件ATGC进行序列拼接,ClustalX1.83进行序列比对,BioEdit剪齐,MEGA4.0进行同源性分析和构建系统进化树.结果 CoxB4河南分离株VP1区长852 bp,与GenBank公布的其他分离株核苷酸相似性为80.3％ ～97.0％,氨基酸相似性96.1％～100％;与糖尿病患者分离株E2核苷酸差异大为19.7％,与手足口病分离株差异小为3.0％.系统进化树显示CoxB4河南分离株属于Genotype Ⅴ型,手足口病分离株与脑膜炎分离株遗传距离较近,分布在一簇中,糖尿病患者分离株在另外一簇.结论 河南地区手足口病感染CoxB4病毒存在Genotype Ⅴ型传播和流行.
