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  • 海南岛两株甲病毒基因组3'末端核苷酸序列的克隆与分析

    作者:赵文忠;赵春生;方美玉;蒋廉华;林立辉;周国林;何海怀;付士红;金奇;梁国栋;侯云德

    目的 从分子水平鉴定海南省分离的两株甲病毒(HBb17和M1病毒)。方法 采用RT-PCR方法 ,分别扩增两株病毒基因组的3'末端核苷酸序列,扩增产物经亚克隆,筛选重组子并测定核苷酸序列对序列进行分析。结果 HBb17和M1病毒分别扩增出约1.6kb和1.3kb的特异片段。序列分析表明,在3'末端非翻译区HBb17病毒与罗斯河病毒(国际标准株T48病毒)核苷酸同源性为99%,M1病毒与鹭山病毒(SAG)同源性为98%;两病毒结构基因的E1区序列,HBb17病毒与罗斯河病毒核苷酸(氨基酸)同源性为99%(99%),M1病毒与鹭山病毒核苷酸(氨基酸)同源性为97%(99%),M1病毒与盖塔病毒同源性为94%(98%)。结论 序列分析表明,海南岛分离的HBb17病毒属于罗斯河病毒,M1病毒可能是鹭山病毒或盖塔病毒的变异株。

  • 一株鹭山病毒的分子生物学鉴定

    作者:赵文忠;罗招凡;刘建伟;方美玉

    目的采用分子生物学方法鉴定一株甲病毒M1.方法 M1病毒在C6/36细胞中增殖,用TRIZOL法提取总RNA.采用RT-PCR方法扩增目的片段,并将其克隆到T载体中,筛选重组子并测定其核苷酸序列.用NCBI/BLAST程序进行同源性收索.结果 M1病毒扩增出469 bp的特异片段,且包含SAG特有的100nt片段.同源性分析表明,该片段与SAG、GET相对应片段同源性为95%,91%.结论 M1病毒属于鹭山病毒.

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