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GeXP联合多重PCR系统在腹泻病毒检测中的应用
目的 利用GeXP系统结合多重PCR技术,建立诺如病毒(GⅠ和GⅡ组)、轮状病毒、星状病毒的方法.方法 根据4种病毒的序列特征,制备病毒标准品质粒,收集病原体样本,利用GenBank下载4种病毒的核苷酸序列,根据4种病毒的序列特征,利用GeXP express Profiler设计特异性引物,优化条件使GeXP系统能够特异性、快速的检测对应病毒.评价其灵敏度、特异性及功效,并应用于120份临床标本检测.结果 优化后的引物能特异性的检测各病毒,无交叉反应;灵敏度为100％,特异性为99.53％,功效为99.62％,与荧光定量PCR检测结果一致性为99.51％,检测浓度低至5×103/ μ1拷贝,在已知临床样本灵敏度高、特异性好.结论 GeXP方法的建立为快速、准确的检测这4种腹泻病毒提供了便利,对口岸突发群体性腹泻的病原体检出有重要意义.
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GeXP多重PCR法与新型Cervista酶切信号扩大法检测高危型HPV DNA的比较
目的 比较基于GenomeLabTM GeXP(GenomeLab eXpress Profiling)遗传分析系统的多重PCR法与新型Cervista酶切信号扩大法(Cervista HR-HPV),检测子宫颈脱落细胞高危型HPV DNA的差异.方法 收集妇科门诊449例患者宫颈脱落细胞样本,分别采用GeXP多重PCR法和Cervista HR-HPV法检测HPV DNA,分析2种方法检测的阳性率和一致率,对其不一致的结果进行基因测序验证.结果 Cervista HR-HPV和GeXP多重PCR法检测阳性率分别为25.84％和32.07％,差异有统计学意义(P＜0.05),2种方法在不同细胞学病变分组人群中的阳性率比较差异均无统计学意义(P＞0.05);2种方法的总一致率为87.08％,具有高度的一致性(Kappa值为0.69);2种方法不一致的病例经测序验证后,Cervista HR-HPV、GeXP多重PCR法结果与测序结果的吻合率分别为46.15％、53.84％.结论 GeXP多重PCR法与Cervista HR-HPV法在检测宫颈脱落细胞高危型HPV DNA的结果具有高度的一致性.
