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多位点可变数量串联重复序列分析(MLVA)文献资料
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山西省人源羊种布鲁氏菌的MLVA-2 B及rpoB基因分型研究
目的：采用多位点可变数目串联重复序列分析( MLVA-2B)方法及rpoB基因分型方法对山西省分离的布鲁氏菌进行基因型分析。方法2014—2015年在山西省布鲁菌病(简称布病)监测点采集已确诊的布病患者血液进行血培养,对培养出的布鲁氏菌进行传统的生物分型鉴定。选取MLVA panel 2的8个位点进行分型,并对分型结果进行聚类分析。同时采用PCR方法对分离菌株rpoB基因4个相关突变位点进行扩增,PCR 产物测序结果与标准菌16M 进行比对。结果采用MLVA panel 2B分型方法对41株羊3型布氏菌进行聚类分析,所有菌株可分为5个群,31个基因型,基因型相似度在64.78%~100%。 rpoB基因检测发现39株为 rpoB-2型(629-GTG/985-GTC/1309-CTA,95.12%),2株为rpoB-2 variant型(629-GTG/1309-CTA,4.88%)。结论 MLVA基因分型对追溯传染源,分析布病的流行和暴发有重要意义。 MLVA panel 2B位点变异度更高,提示用panel 2B的5个位点对分析研究同一生物型菌株的变异情况更简便和高效。应用rpoB基因多态性分析发现,我省的菌株有39株为rpoB-2型,还有2株为新发现的rpoB-2突变型。同时发现了rpoB基因分型与MLVA分型方法可能存在相关性。
