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台湾东部耐多药结核病的分子流行病学研究
台湾从2007年5月启动了耐多药结核病项目.在台湾东部,自2007年5月到2009年2月共纳入了77例耐多药结核病(MDR-TB)患者.获取了其中的73例(93%)患者的分离株以应用间隔区寡核苷酸基因分型(spoligotyping)和MIRU-VNTR(分枝杆菌分散重复单位-可变数目的串联重复序列)进行基因分型.spoligotyping的分析结果表明,北京基因型是主要的流行基因型(n=48,66%).在73株菌株中,28(38.4%)株有独特的基因型,45(61.6%)株菌株成簇.在45位基因型成簇的患者中,有2l例患者发现存在流行病学联系.在台湾东部MDR结核病患者的菌株成簇比例高.
关键词： 耐多药结核病 间隔区寡核苷酸基因分型 传播 MIRU-VNTR -
杭州地区结核分枝杆菌氧氟沙星耐药株的MIRU-VNTR基因分型研究
目的：探讨MIRU-VNTR技术在杭州地区结核分枝杆菌氧氟沙星耐药株基因分型中的应用。方法收集杭州市2010年4月-2012年6月各结核病定点医院分离培养的临床菌株，进行药物敏感性检测。分别采用RD105缺失基因检测法和MIRU-VNTR技术对氧氟沙星耐药株进行菌株鉴定和基因分型。结果筛选出的52株氧氟沙星耐药株中，43株（82.69%）为北京家族菌株。经12个MIRU-VNTR位点组合分析，52株氧氟沙星耐药株呈52种MIRU-VNTR基因型，总Hunter-Gaston指数（ HGI）为0.999。除MIRU40和ETR-F外，其他10个MIRU-VNTR位点对北京家族菌株和非北京家族菌株均显示较高或中等程度的分辨率。结论筛选到的10个MIRU-VNTR位点具有较高分辨率，适用于杭州地区结核分枝杆菌氧氟沙星耐药株分型。
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西藏藏族结核分枝杆菌临床分离株的MIRU-VNTR基因多态性分析与评价
目的 了解西藏地区藏族人群中结核分枝杆菌24位点MIRU-VNTR的基因多态性及其评价.方法 应用欧盟推荐的24位点MIRU-VNTR分型方法,将本次分型结果与MIRU-VNTRplus数据库进行比对,并应用BioNumerics5.0软件进行聚类分析.结果 577株结核分枝杆菌分为347种基因型,其中299株分为69个基因簇,另278株表现为独特的基因型.MIRU31、Qub11b2、Qub26、Qub4156c、Mtub21、MIRU20和MIRU26七个位点对西藏地区藏族人群中结核分枝杆菌临床分离株的分辨力较高,另17个位点的分辨力较低,其中MIRU24位点分辨率为0.结论 西藏地区藏族人群中结核分枝杆菌MIRU-VNTR分型具有良好的多态性,且该地区以现代型结核分枝杆菌为流行优势菌.
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MIUR-VNTR在乌鲁木齐市耐药结核分枝杆菌基因分型中位点稳定性的研究
目的 通过对MIRU-VNTR分型技术在新疆乌鲁木齐市耐药结核病基因分型的研究,明确乌鲁木齐市12个标准VNTR分型位点的稳定性,为结核病耐药菌株演变、病源追踪、暴发调查及快速诊断等方面提供理论依据.方法 采用间隔重复单元的可变数目串联重复序列(Mycobacteral interspersed repetive units-Variable number tandem repeat,MIRU-VNTR)分型方法,选择标准12位点VNTR,对65例耐药结核分枝杆菌进行DNA检测,使用MIRU-VNTR数据分析网站进行聚类分析,并进行分辨率指数(HGI)及VNTR等位基因多态性分析.结果 12个VNTR位点等位基因多态性存在差异;除MIRU26位点分辨率较低(h =0.3381)外,其余各位点分辨率均较高(h＞0.6);65株菌株可分4大群、3种基因型,成5簇,成簇率为29.231％;结论 乌鲁木齐市耐药结核分枝杆菌12个标准VNTR位点等位基因多态性保持较为稳定;采用标准12位点MIRU-VNTR技术对耐药结核病进行基因分型、成簇性分析等分子流行病研究,所得结果可靠.
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MIRU-VNTR在耐多药结核病分子流行病学中的应用进展
耐多药结核病仍然是全球重要的公共卫生问题之一.多位点数目可变串联重复序列分析(mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat typing,MIRU-VNTR)方法是一种简单快速的结核分枝杆菌基因分型方法,与其他分型方法结合,表现了与金标准RFLP相似的分辨力,已逐渐成为耐多药结核病分子流行病学研究中的重要工具.MIRU-VNTR主要应用于以下方面:①探索耐多药结核病传播机制;②接触者调查和爆发同源性调查;③区分再感染与复燃;④揭示结核杆菌菌种多样性和群体遗传关系;⑤与GPS结合,描述各地结核病传播风险"热点"地图;⑥预测结核分支杆菌耐药性.
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利用MIRU-VNTR分型技术对结核病患者多重感染现象的分析
目的:对结核病患者进行结核分枝杆菌多重感染现象分析.方法:在山东省胸科医院2015年1月到2016年11月的临床患者中,挑选同一患者存在2个或2个以上分离株,且一线药物(利福平、异烟肼、链霉素、乙胺丁醇)药敏结果耐药表型不同的作为研究对象.利用MIRU-VNTR方法对25例患者共53个分离株进行基因型分析.结果:25例患者中,6例患者的分离株存在不同基因型.结论:本研究中证实山东省胸科医院存在结核分枝杆菌多重感染现象,了解多重感染对于药敏结果的判断和治疗方案的评价有非常重要的意义,临床医师应该引起足够的重视.
