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应用16S rRNA基因序列分析与细菌生化反应鉴定湖生代夫特菌
目的 对某医院术后感染中分离到的4株不常见病原菌进行菌种鉴定.方法 采用16S rRNA基因序列的测定、细菌形态学以及商品化的VITEK-2 GN、API 20NE系统相结合的多相分类学方法.结果 该4株菌均为需氧的革兰阴性非发酵菌,其氧化酶阳性,在血平板、巧克力平板、麦康凯平板等常用培养基上生长良好;采用VITEK-2 GN与API 20NE系统,该4株菌均鉴定为食酸代夫特菌/食酸丛毛单胞菌,并显示为极好的鉴定度;但16S rRNA基因序列分析的结果显示,该4株菌与食酸代夫特菌的相似度仅为98.4%,而与鹤原代夫特菌、湖生代夫特菌的同源性更高,分别为99.9%和100.0%;其甘露醇同化试验与苹果酸同化试验阳性,与湖生代夫特菌一致而不同于鹤原代夫特菌.结论 该术后感染的4株病原菌均为湖生代夫特菌,16S rRNA基因序列分析能提供有力的遗传学证据.
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代夫特菌属的研究进展
代夫特菌属是1999年建立的一个新菌属,属于变形菌β亚纲、丛毛单胞科.该属细菌为氧化酶、触酶均阳性,不发酵葡萄糖,不形成芽孢的革兰阴性杆菌.对氨基糖苷类抗生素天然耐药.广泛分布于自然界.为人类少见的机会致病菌.本文针对代夫特菌属的分类、生物学特性、耐药特征、鉴定以及临床感染等问题进行讨论.