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应用16S rRNA基因序列分析与细菌生化反应鉴定湖生代夫特菌
目的 对某医院术后感染中分离到的4株不常见病原菌进行菌种鉴定.方法 采用16S rRNA基因序列的测定、细菌形态学以及商品化的VITEK-2 GN、API 20NE系统相结合的多相分类学方法.结果 该4株菌均为需氧的革兰阴性非发酵菌,其氧化酶阳性,在血平板、巧克力平板、麦康凯平板等常用培养基上生长良好；采用VITEK-2 GN与API 20NE系统,该4株菌均鉴定为食酸代夫特菌/食酸丛毛单胞菌,并显示为极好的鉴定度；但16S rRNA基因序列分析的结果显示,该4株菌与食酸代夫特菌的相似度仅为98.4％,而与鹤原代夫特菌、湖生代夫特菌的同源性更高,分别为99.9％和100.0％;其甘露醇同化试验与苹果酸同化试验阳性,与湖生代夫特菌一致而不同于鹤原代夫特菌.结论 该术后感染的4株病原菌均为湖生代夫特菌,16S rRNA基因序列分析能提供有力的遗传学证据.
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应用16S rRNA基因序列分析与细菌生化反应鉴定膝关节脓液分离的念珠状链杆菌
目的：对我院一名患者左膝关节脓液中分离到的1株少见病原菌进行16S rRNA基因测序鉴定，探讨该方法在临床病原菌鉴定方面的意义。方法：采用16S rRNA基因序列的测定、细菌形态学以及商品化的Vitek 2全自动细菌鉴定药敏系统、API 20NE、API 20E与API 50CH系统的生化实验进行细菌的表型鉴定。结果：该菌在血平板和巧克力平板生长缓慢，麦康凯平板不生长；血平板上菌落形态呈1～2 mm“油煎蛋”圆形凸起，边缘光滑、半透明、湿润；镜下革兰染色阴性，呈链状排列，菌体1～3μm，呈圆形、卵圆形或梭形等；Vitek 2 GN-13、API 20NE、API 20E均为不能鉴定的细菌；16S rRNA基因序列分析的结果显示该菌与念珠状链杆菌的相似度为100％。结论：该膝关节脓液分离出的病原菌为念珠状链杆菌，16S rRNA基因序列分析能提供有力的遗传学证据，结合细菌的生化反应可准确地鉴定该菌。
