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鲍氏不动杆菌医院感染株亲缘性分析3种方法学的比较
目的 鲍氏不动杆菌(ABA)医院感染株亲缘性3种分析方法学的比较.方法 分别采用脉冲场凝胶电泳(PFGE),扩增片段长度多态性分析(AFLP)和多基因聚类分析对27株鲍氏不动杆菌临床分离株进行分析.结果 PFGE分析显示其中的19株鲍氏不动杆菌为同一克隆传播;AFLP显示24株鲍氏不动杆菌为同一克隆传播;而多基因聚类分析则显示,携带8种基因(TEM、OXA-23群、ADC、aac(3)-Ⅰ、aac(6')-Ⅰ、ant(3")-Ⅰ、qacE△1-sul1、int Ⅰ 1)、携带7种基因(TEM、ADC、aac(3)-Ⅰ、aac(6')-Ⅰ、ant(3")-Ⅰ、qacE△1-sul1、int Ⅰ 1)、携带6种基因(TEM、ADC、aac(3)-Ⅰ、ant(3")-Ⅰ、qacE△1-sul1、int Ⅰ 1)的3种ABA克隆为医院的流行株(3个克隆).结论 鲍氏不动杆菌医院感染株亲缘性分析中多基因聚类分析法分辨率高于PFGE与AFLP法.
关键词: 鲍氏不动杆菌 脉冲场凝胶电泳 扩增片段长度多态性分析 多基因聚类分析 -
喹诺酮耐药鲍曼不动杆菌的AFLP基因分型研究
目的 通过对喹诺酮耐药鲍曼不动杆菌(AB)的扩增片段长度多态性分析(AFLP),了解鲍曼不动杆菌的同源性,并探讨其耐药基因分型与AFLP分型之间的联系.方法 Primer Premier5软件设计11对喹诺酮耐药基因,利用PCR技术对52株喹诺酮耐药鲍曼不动杆菌进行分析,同时使用扩增片段长度多态性分析(AFLP)技术研究基因型,Cross Checker和ntsys软件分析耐药基因和UPGMA方法分析AFLP基因的树型聚类情况.结果 52株鲍曼不动杆菌均对喹诺酮类药物耐药.由聚类分析的结果显示,该52株AB可分2个基因群,其中A群包括A1、A2和A3三个亲缘关系相近的基因型,B群则包括B1和B2两个亲缘关系相近的基因型,A1型为优势菌群.同型的A27、28、30、32、37、47、56均分离自ICU,ICU可能存在过耐药AB的暴发流行.通过与前期研究比较,耐药基因的多基因聚类分析与AFLP树型聚类分析具有一致性也存在不同之处.结论 ICU或许已成为耐药AB菌传播的一个重要枢纽.两种细菌分类方法各有优势,AFLP法是针对全细菌基因组的限制性酶切,在调查细菌流行病学和监控医院整体感染情况方面更权威.
关键词: 鲍曼不动杆菌 扩增片段长度多态性分析 多基因聚类分析