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TXNIP基因多态性和启动子区的生物信息学分析
目的：探究TXNIP的基因多态性和启动子区甲基化CpG岛、转录因子结合位点。方法利用生物信息学在线软件获得TXNIP基因3′UTR多态性和mRNA的表达情况；利用相关软件获得TXNIP启动子区序列，预测甲基化CpG岛及转录因子结合部位。结果 TXNIP基因3′UTR多态性位点rs7211、 rs7212和rs4755的不同基因型与mRNA表达差异有统计学意义( P<0．05)；启动子区序列中甲基化CpG岛位于1763~1943 bp处。结论利用生物信息学分析可以更有效地了解基因多态性和启动子区在基因表达调控中的作用。
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hsa-miR-1908上游启动子区的生物信息学分析
目的：利用各种生物信息学工具预测hsa-miR-1908上游启动子功能，以进一步研究其在人脂肪细胞中的转录调控机制。方法应用Ensemble数据库获取hsa-miR-1908上游启动子序列，利用多种在线相关软件预测出甲基化部位和转录因子结合部位。结果获取hsa-miR-1908上游启动子序列全长1458 bp。miR-1908启动子序列中CpG岛位于（438～756）bp、（836～937）bp、（979～1374）bp处，CpG岛的存在会抑制miR-1908启动子的转录。miR-1908有15个转录因子的结合位点。结论 miRNA启动子相关生物信息学的研究，提高对启动子的研究效率，为进一步研究miR-1908的转录调控机制提供了重要的信息。
关键词： miR-1908启动子区 生物信息学分析 转录因子结合部位 -
生物信息学在基因转录调控研究中的应用
基因表达调控机制是后基因组时代一个重要的研究内容.基因正确的表达有赖于一个复杂的调控系统,而转录因子与转录因子结合部位的相互作用是这一系统的重要组成部分.不同的转录因子对外界环境的各种刺激或不同发育阶段的各种信号做出反应,结合于转录调控元件,激活或抑制基因的转录,从而控制不同基因的表达.
