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转移潜能不同的人前列腺癌细胞系差异膜蛋白质组学的分析
目的:通过应用鸟枪法蛋白质组学技术发现早期诊断和逆转前列腺癌转移的分子标志.方法:应用鸟枪法蛋白质组学技术,比较人高转移前列腺癌细胞株(PC-3M) 和人低转移前列腺癌细胞株(PC-3) 间膜蛋白表达的差异.用SDS-PAGE 胶分离膜蛋白, 并且进行胰酶消化,用反相液相色谱分离肽混合物后进行ESI-MS/MS鉴定,用数据库查询结合生物信息学技术比较分析并识别细胞间的差异表达膜蛋白.结果:1)利用Gel-1DLC-MS/MS 分析,在严格的过滤参数条件下鉴定了PC-3和PC-3M两种细胞中的蛋白,在PC-3细胞中鉴定了2 172个蛋白,在PC-3M细胞中鉴定了2 023个蛋白.2)用GOA分析软件进行分类,PC-3细胞中1 499个蛋白为已知细胞组分,其中564 (38.13%) 个蛋白为膜蛋白或者膜相关蛋白;PC-3M 细胞中1 391个蛋白为已知细胞组分,细胞组分中527(38.30%)个为膜蛋白或者膜相关蛋白.几个假设蛋白和cDNA序列也被预测.3)用蛋白名称和IPI数据库号对比分析后发现有161个蛋白质仅在PC-3前列腺癌细胞株中检测到有表达,135个蛋白质仅在PC-3M中检测到有表达.结论:人高、低转移前列腺癌细胞株的膜蛋白表达存在明显差异,为进一步发现前列腺癌转移相关分子和阐明前列腺癌侵袭转移的分子机制提供实验证据.
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人高转移性和低转移性前列腺癌细胞株荧光差异凝胶电泳图像分析
目的:比较人高转移性前列腺癌细胞株(PC-3M)和人低转移性前列腺癌细胞株(PC-3)间差异表达的蛋白质,拟发现早期诊断和逆转前列腺癌转移的分子标志物.方法:应用差异凝胶电泳(DIGE),分离PC-3M和PC-3细胞株的总蛋白,用图像分析软件比较分析并识别细胞间的差异表达蛋白质.结果:应用DIGE进行分离后,成功地获得了蛋白质组分辨率高、重复性好的双向凝胶电泳图谱,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)成功鉴定出11种蛋白质,其中9个蛋白质点仅在PC-3中有表达,2个蛋白质点仅在PC-3M中有表达.结论:人高、低转移前列腺癌细胞株的蛋白质组表达存在明显差异,这些差异蛋白质有可能为进一步发现前列腺癌转移相关分子和阐明前列腺癌侵袭转移的分子机制提供实验证据.