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膜蛋白质组文献资料
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膜蛋白质组分析技术的研究进展
膜蛋白在细胞中执行着一些非常重要的功能.膜蛋白的溶解性是膜蛋白质组分析面临的主要挑战.膜蛋白溶解性的提高,使得经典的基于凝胶的蛋白质组策略和新兴的鸟枪蛋白质组策略在膜蛋白质组分析中逐渐被广泛应用,进而可以揭示膜蛋白的拓扑学特征和鉴定其翻译后修饰,为深入研究其重要的生物学功能积累数据.
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不同转移潜能鼻咽癌细胞株的差异膜蛋白质组研究
目的:采用定量蛋白质组学技术筛选鼻咽癌转移相关的膜蛋白质.方法:在富集高转移鼻咽癌细胞株5-8F和不转移鼻咽癌细胞株6-10B膜蛋白质的基础上,采用稳定同位素18O标记结合串联质谱技术比较两株细胞膜蛋白质组的差异,采用Western印迹对差异表达膜蛋白质EphA2的表达水平进行验证,采用生物信息学方法对差异蛋白质进行GO(gene oncology)功能聚类和全基因组及代谢途径数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路分析.结果:鉴定了31个5-8F与6-10B细胞的差异膜蛋白,其中25个蛋白质在5-8F中表达上调、6个蛋白质表达下调,Western印迹技术验证了差异膜蛋白质EphA2的表达.生物信息分析显示,差异膜蛋白的功能主要涉及细胞黏附、受体再循环和细胞连接等生物学过程,并参与了14个KEGG通路,其中许多通路涉及细胞黏附、细胞连接以及细胞运动.结论:31个差异膜蛋白质可能在鼻咽癌转移过程中发挥重要作用,为进一步研究鼻咽癌转移的分子机制提供了新线索.
