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三个非核苷类逆转录酶抑制剂S-DABO类衍生物的体外抗HIV作用
本文对3个新S-DABO类衍合物(RZK-4、RZK-5、RZK-6)的体外抗HIV活性进行了研究.化合物RZK-4、RZK-5和RZK-6在200 μg·mL~(-1)的浓度下均能完全抑制HIV-1逆转录酶的活性.3个化合物对多种细胞均呈现出低毒性,且均在较低浓度下具有抑制HIV-1病毒实验株、临床株和耐药株的作用,治疗指数为3 704～38 462.其中,化合物RZK-6对HIV-1耐药株HIV-1_(ⅢB) A17具有非常显著的抑制作用.结果表明,这3种S-DABO类衍生物有良好的体外抗HIV-1作用,具有开发成为抗HIV-1药物的前景.
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S-DABO类非核苷类逆转录酶抑制剂分子对接及Field-Based QSAR研究
HIV-1逆转录酶抑制剂是鸡尾酒疗法,即高效抗逆转录病毒治疗的主要组成成分,S-DABO系列化合物及其类似骨架对HIV-1逆转录酶表现出良好的抑制活性.本文基于公共骨架叠合的方法生成了基于场的三维定量构效关系模型(Field-based QSAR model),并通过高斯立体场、静电场、疏水场、氢键供体场、氢键受体场和芳环场来表征.对应的统计学参数训练集交叉验证相关系数R2CV为0.5949,相关系数R2为0.8421,测试集Q2为0.5486,测试集相关系数Pearson-r为0.7460.通过分子对接,分子结合口袋分析以及三维等势图分析,我们得到了关键的药效基团与相互作用:(i)化合物与氨基酸残基Tyr181,Tyr188,Trp229存在π-π相互作用,与His236之间存在σ-π相互作用;(ii)化合物与Lys101之间存在氢键,与Tyr188之间存在卤键.对接分析和Field-based QSAR模型可以为新型HIV-1逆转录酶抑制剂的设计提供借鉴和帮助.
关键词： HIV-1逆转录酶 S-DABOs 分子对接 基于场的三维定量构效关系
